More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0627 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0627  diguanylate cyclase  100 
 
 		 1052 aa  2096    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.256226  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2120  signaling protein  41.77 
 
 		 351 aa  111  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.11 
 
 		 550 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1274  diguanylate cyclase  41.61 
 
 		 593 aa  110  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2008  diguanylate cyclase  38.16 
 
 		 574 aa  109  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1689  diguanylate cyclase  38.16 
 
 		 574 aa  108  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2527  diguanylate cyclase  40 
 
 		 381 aa  108  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2092  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40 
 
 		 545 aa  108  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.403433  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 		 593 aa  106  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1776  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.27 
 
 		 547 aa  106  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4106  GGDEF domain/EAL domain protein  37.66 
 
 		 756 aa  105  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624649  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 		 1073 aa  105  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2763  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.48 
 
 		 751 aa  105  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.256566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.5 
 
 		 668 aa  105  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2653  diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 397 aa  105  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1340  diguanylate cyclase  35.75 
 
 		 581 aa  104  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1313  diguanylate cyclase  35.75 
 
 		 581 aa  104  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.386041  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1304  diguanylate cyclase  35.75 
 
 		 581 aa  105  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00414858  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0319  two component diguanylate cyclase  34.12 
 
 		 661 aa  104  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.99 
 
 		 416 aa  104  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137039  normal  0.392599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2770  diguanylate cyclase  34.68 
 
 		 575 aa  104  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.207836  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2848  diguanylate cyclase  34.1 
 
 		 575 aa  104  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3046  diguanylate cyclase  35.75 
 
 		 581 aa  104  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.860652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0109  diguanylate cyclase  36.54 
 
 		 461 aa  104  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0952  GGDEF domain-containing protein  33.51 
 
 		 430 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1527  diguanylate cyclase  35.84 
 
 		 642 aa  104  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.086696  normal  0.0345548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1526  diguanylate cyclase  35.84 
 
 		 622 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.480144  normal  0.0382354 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3190  diguanylate cyclase  36.54 
 
 		 852 aa  103  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1977  membrane associated GGDEF protein  34.81 
 
 		 583 aa  103  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2754  diguanylate cyclase  34.78 
 
 		 518 aa  104  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0153453 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02671  predicted signal transduction protein containing a membrane domain, an EAL and a GGDEF domain  33.75 
 
 		 531 aa  103  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.84 
 
 		 668 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2607  diguanylate cyclase  40.26 
 
 		 316 aa  103  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000143356  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2380  diguanylate cyclase  35.95 
 
 		 410 aa  103  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  40.91 
 
 		 599 aa  103  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2413  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 544 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  37.41 
 
 		 418 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1232  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.99 
 
 		 416 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  39.35 
 
 		 718 aa  102  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1235  diguanylate cyclase  37.33 
 
 		 577 aa  102  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.41 
 
 		 634 aa  102  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2364  diguanylate cyclase  37.67 
 
 		 351 aa  102  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000850784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3125  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.94 
 
 		 712 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3227  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.66 
 
 		 825 aa  102  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5593  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.24 
 
 		 448 aa  102  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2774  diguanylate cyclase  34.59 
 
 		 530 aa  102  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.18 
 
 		 652 aa  101  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.864277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0312  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.09 
 
 		 454 aa  101  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4752  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.18 
 
 		 652 aa  101  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.724915 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3843  GGDEF  36.36 
 
 		 763 aa  101  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2866  diguanylate cyclase  36.84 
 
 		 401 aa  101  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.692442 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3232  hypothetical protein  35.17 
 
 		 498 aa  101  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0640076  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2188  diguanylate cyclase  39.31 
 
 		 362 aa  101  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1820  diguanylate cyclase  38.62 
 
 		 443 aa  101  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0261  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.58 
 
 		 463 aa  101  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.3078  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5901  diguanylate cyclase  33.56 
 
 		 386 aa  101  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  35.44 
 
 		 462 aa  101  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1348  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  39.35 
 
 		 763 aa  101  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1143  diguanylate cyclase  36.9 
 
 		 532 aa  101  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0392  diguanylate cyclase  36.91 
 
 		 319 aa  101  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0549299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1834  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.49 
 
 		 571 aa  100  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000228382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4172  GGDEF domain-containing protein  34.23 
 
 		 431 aa  100  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1480  GGDEF family protein  33.53 
 
 		 596 aa  101  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 632 aa  100  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0021  diguanylate cyclase  35.62 
 
 		 423 aa  100  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.76 
 
 		 916 aa  100  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4249  hypothetical protein  37.82 
 
 		 434 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.96 
 
 		 1016 aa  100  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1952  diguanylate cyclase  39.33 
 
 		 937 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.105215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0795  diguanylate cyclase  38.06 
 
 		 249 aa  99.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0100  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 446 aa  100  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.246337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00808  hypothetical protein  36.54 
 
 		 578 aa  99.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3282  diguanylate cyclase  32.87 
 
 		 523 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 		 1644 aa  100  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3369  diguanylate cyclase  33.77 
 
 		 459 aa  100  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1511  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.48 
 
 		 557 aa  100  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00005186  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0333  GGDEF domain-containing protein  39.74 
 
 		 364 aa  100  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0124  diguanylate cyclase  38.67 
 
 		 492 aa  99.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00884448  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1184  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.41 
 
 		 738 aa  100  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1641  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.84 
 
 		 640 aa  99.8  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.320869  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2946  diguanylate cyclase  32.95 
 
 		 575 aa  100  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2451  diguanylate cyclase  37.58 
 
 		 287 aa  100  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.357432  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3412  hypothetical protein  31.75 
 
 		 423 aa  99.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0269335  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4131  diguanylate cyclase  35.26 
 
 		 369 aa  99.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.08 
 
 		 719 aa  100  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0697  diguanylate cyclase  38.1 
 
 		 482 aa  100  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000140018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1885  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.84 
 
 		 558 aa  99.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2418  GGDEF domain-containing protein  33.33 
 
 		 518 aa  100  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.659104 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3236  hypothetical protein  31.75 
 
 		 423 aa  99.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0104131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  34.81 
 
 		 803 aa  100  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.03 
 
 		 415 aa  99.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2434  extracellular solute-binding protein  38.67 
 
 		 937 aa  99.4  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  36.67 
 
 		 609 aa  99.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  35.9 
 
 		 709 aa  99.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.1 
 
 		 686 aa  99.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2239  diguanylate cyclase  34.57 
 
 		 387 aa  99.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4323  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.6 
 
 		 743 aa  99.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366607  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1443  diguanylate cyclase  39.33 
 
 		 376 aa  99.4  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000552485  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1536  diguanylate cyclase  36.77 
 
 		 278 aa  99.4  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370191  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00065  GGDEF/EAL domain protein  39.74 
 
 		 814 aa  99.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>