169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2030 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  100 
 
 		 510 aa  1024    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  57.36 
 
 		 607 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  51.68 
 
 		 524 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  43.65 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  30.34 
 
 		 558 aa  206  6e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  30.06 
 
 		 516 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  29.07 
 
 		 533 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  29.72 
 
 		 541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  29.55 
 
 		 551 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  29.17 
 
 		 544 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  30.87 
 
 		 517 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  29.21 
 
 		 548 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  27.67 
 
 		 551 aa  150  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  28.24 
 
 		 517 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  31.02 
 
 		 517 aa  146  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  30.48 
 
 		 514 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  28.66 
 
 		 551 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  32.85 
 
 		 516 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  29.92 
 
 		 502 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  30.1 
 
 		 514 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  30.1 
 
 		 514 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  29.15 
 
 		 514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  29.55 
 
 		 514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  29.14 
 
 		 500 aa  130  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  30.72 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  29.23 
 
 		 974 aa  104  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  38.12 
 
 		 203 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  33.33 
 
 		 248 aa  96.7  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  34.55 
 
 		 220 aa  90.9  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  24.58 
 
 		 471 aa  87  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  26.94 
 
 		 307 aa  85.9  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  28.02 
 
 		 1078 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  27.83 
 
 		 1078 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1079 aa  83.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  29.82 
 
 		 251 aa  79.7  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  29.52 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  27.67 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7525  hypothetical protein  33.72 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  36.05 
 
 		 284 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  28.22 
 
 		 475 aa  73.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  25.16 
 
 		 991 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  23.79 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  24.44 
 
 		 749 aa  70.5  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  25.05 
 
 		 982 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  26.17 
 
 		 837 aa  64.7  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  30.1 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  27.43 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  32.3 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  29.79 
 
 		 803 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  29.58 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 304 aa  62  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  24.53 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  29.58 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  26.72 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  29.58 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  25.44 
 
 		 844 aa  60.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  25.23 
 
 		 842 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  29.94 
 
 		 538 aa  60.1  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  24.53 
 
 		 253 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  22.08 
 
 		 782 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  30.6 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  28.67 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  30.6 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  27.18 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  29.21 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  30.32 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  35.29 
 
 		 876 aa  57  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  26.6 
 
 		 830 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  25.44 
 
 		 255 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  23.67 
 
 		 308 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  26.7 
 
 		 320 aa  56.6  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  28.42 
 
 		 271 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  26.99 
 
 		 231 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  28.38 
 
 		 277 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  29.67 
 
 		 520 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  28.19 
 
 		 271 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  30.97 
 
 		 285 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  39.53 
 
 		 759 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  28.48 
 
 		 284 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  33.04 
 
 		 259 aa  53.9  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  30.77 
 
 		 520 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  30.77 
 
 		 520 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  27.84 
 
 		 819 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  30.46 
 
 		 281 aa  53.5  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  25.53 
 
 		 1017 aa  53.5  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  28.85 
 
 		 261 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3881  O-methyltransferase family protein  38.6 
 
 		 221 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.56879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  32.5 
 
 		 281 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  31.62 
 
 		 267 aa  52.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  28.72 
 
 		 249 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  23.61 
 
 		 515 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  27.7 
 
 		 283 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  25.87 
 
 		 528 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  31.06 
 
 		 1040 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  33.52 
 
 		 836 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  30.77 
 
 		 273 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  38.46 
 
 		 752 aa  51.2  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  29.38 
 
 		 266 aa  51.2  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  39.53 
 
 		 759 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  28.67 
 
 		 268 aa  50.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>