168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1487 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  59.61 
 
 		 916 aa  1180    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0102  pilx4 protein  41.7 
 
 		 876 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.894843 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  45.96 
 
 		 915 aa  876    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  100 
 
 		 915 aa  1900    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  34.57 
 
 		 922 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  32.18 
 
 		 924 aa  522  1e-146  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  35.07 
 
 		 831 aa  516  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  35.07 
 
 		 831 aa  515  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  37.2 
 
 		 830 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6325  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  34.21 
 
 		 829 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  36.22 
 
 		 822 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0450  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  36.43 
 
 		 823 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  36.84 
 
 		 822 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6504  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  35.78 
 
 		 821 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  34.39 
 
 		 826 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  34.48 
 
 		 826 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  34.48 
 
 		 826 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  34.74 
 
 		 830 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  34.4 
 
 		 816 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  30.65 
 
 		 815 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  38.82 
 
 		 561 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  31.3 
 
 		 788 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.42 
 
 		 796 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  31.77 
 
 		 785 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.25 
 
 		 790 aa  366  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.14 
 
 		 793 aa  364  5.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5816  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  31.62 
 
 		 835 aa  360  6e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  29.54 
 
 		 805 aa  352  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.98 
 
 		 804 aa  320  7e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  28.52 
 
 		 839 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.18 
 
 		 805 aa  319  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.42 
 
 		 819 aa  316  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  29.82 
 
 		 819 aa  315  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.05 
 
 		 803 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6159  type IV secretion system protein VirB4  27.83 
 
 		 789 aa  293  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0089682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3523  type IV secretion system protein VirB4  27.39 
 
 		 797 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8224  type IV secretion system protein VirB4  27.18 
 
 		 789 aa  285  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  26.52 
 
 		 800 aa  283  1e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  27.35 
 
 		 803 aa  278  3e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  26.05 
 
 		 801 aa  278  5e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  26.28 
 
 		 800 aa  276  2.0000000000000002e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7347  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.26 
 
 		 849 aa  266  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327754 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08213  conjugal transfer protein TraE  27.14 
 
 		 752 aa  239  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5026  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  27.13 
 
 		 804 aa  224  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.451352  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  26.58 
 
 		 787 aa  223  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0012  conjugal transfer protein  28.31 
 
 		 792 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.829213 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3819  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  26.33 
 
 		 791 aa  220  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.321786  normal  0.020067 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0153  hypothetical protein  27.97 
 
 		 826 aa  219  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0171  hypothetical protein  27.63 
 
 		 826 aa  216  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  26.5 
 
 		 791 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7534  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.29 
 
 		 857 aa  211  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339872  normal  0.0463504 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0030  conjugal transfer protein  23.98 
 
 		 841 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  19.33 
 
 		 788 aa  145  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  22.37 
 
 		 824 aa  143  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  23.48 
 
 		 813 aa  137  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  22.64 
 
 		 823 aa  132  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  22.67 
 
 		 810 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  21.41 
 
 		 850 aa  131  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  23.18 
 
 		 816 aa  129  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  23.73 
 
 		 820 aa  128  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  22.51 
 
 		 823 aa  127  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  22.84 
 
 		 808 aa  125  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  22.22 
 
 		 817 aa  125  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  23.43 
 
 		 813 aa  125  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  22.09 
 
 		 817 aa  124  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  23.06 
 
 		 816 aa  124  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  23 
 
 		 816 aa  124  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  22.09 
 
 		 809 aa  123  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  22.15 
 
 		 819 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  22.98 
 
 		 811 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  22.82 
 
 		 819 aa  121  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  22.12 
 
 		 825 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  22.9 
 
 		 817 aa  120  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  22.65 
 
 		 816 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  24.03 
 
 		 812 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  25.09 
 
 		 816 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2228  conjugal transfer protein TrbE  22.18 
 
 		 854 aa  118  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0444639  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5229  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.7 
 
 		 846 aa  117  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.738503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  20.62 
 
 		 827 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1717  conjugal transfer ATPase TrbE  23.12 
 
 		 819 aa  116  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.137188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  21.86 
 
 		 817 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  22.51 
 
 		 819 aa  115  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5221  conjugal transfer ATPase TrbE  21.78 
 
 		 819 aa  113  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0839  type IV secretion system protein VirB5  20.05 
 
 		 791 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0234971  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  23.45 
 
 		 816 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  21.25 
 
 		 687 aa  111  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1041  type IV secretion system protein VirB4  19.86 
 
 		 791 aa  107  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  21.95 
 
 		 830 aa  107  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  22.76 
 
 		 815 aa  107  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  23.21 
 
 		 840 aa  106  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  22.18 
 
 		 817 aa  105  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5609  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.1 
 
 		 825 aa  105  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6505  conjugal transfer protein TrbE  20.82 
 
 		 852 aa  104  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158384  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6632  conjugal transfer protein TrbE  20.82 
 
 		 852 aa  104  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  20.69 
 
 		 852 aa  103  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  21.86 
 
 		 829 aa  102  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  22.99 
 
 		 840 aa  100  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  22.99 
 
 		 840 aa  100  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  22.21 
 
 		 813 aa  100  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6506  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.39 
 
 		 825 aa  100  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>