197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6022 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 319 aa  655    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  56.38 
 
 		 325 aa  346  4e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  48.53 
 
 		 319 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  44.29 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  35.76 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  31.86 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  33.7 
 
 		 487 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  30 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  31.43 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  29.86 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  29.17 
 
 		 524 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  29.33 
 
 		 522 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  30.15 
 
 		 501 aa  95.9  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  31.48 
 
 		 855 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  27.8 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  31.66 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  28.04 
 
 		 348 aa  90.5  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  26.77 
 
 		 495 aa  89.4  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  28.53 
 
 		 450 aa  89.4  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  26.39 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.89 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  30.03 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.7 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  28.02 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  30 
 
 		 566 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 		 563 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  28.29 
 
 		 533 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  29.07 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  27.38 
 
 		 505 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  27.76 
 
 		 524 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  28.52 
 
 		 644 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.03 
 
 		 538 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.94 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  30.45 
 
 		 517 aa  72.4  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  28.91 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  27.89 
 
 		 519 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  28.41 
 
 		 498 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  27.64 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  26.41 
 
 		 527 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  29.51 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.38 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  24.32 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  27.56 
 
 		 525 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  26.07 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  25.1 
 
 		 497 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  26.83 
 
 		 699 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  29.34 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  27.48 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  26.07 
 
 		 618 aa  65.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  26.2 
 
 		 713 aa  65.9  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2371  glycoside hydrolase family 43  25.26 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  27.81 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  28.81 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.89 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  29.6 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  27.52 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  28.34 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  26.32 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.22 
 
 		 444 aa  62.8  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.8 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.76 
 
 		 577 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  21.8 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1512  glycoside hydrolase family 43  25.38 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.416427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  25.68 
 
 		 526 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  26.17 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  26.47 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.15 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  30.46 
 
 		 536 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  27.2 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  28.06 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  27.78 
 
 		 468 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.79 
 
 		 562 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 516 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  27.8 
 
 		 537 aa  59.3  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  26.32 
 
 		 510 aa  59.3  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  27.52 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 571 aa  59.3  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  26.61 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  26.79 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  27.31 
 
 		 522 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  25.18 
 
 		 542 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  27.92 
 
 		 746 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  25.1 
 
 		 586 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  25.49 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  28.63 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.1 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  24.54 
 
 		 535 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  25.69 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  27.09 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  24.91 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  29.24 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 		 665 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.62 
 
 		 540 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  24.56 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>