More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1602 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  43.84 
 
 
1051 aa  862    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  40.68 
 
 
1086 aa  803    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  43.34 
 
 
1086 aa  899    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  100 
 
 
1080 aa  2229    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  43.22 
 
 
1052 aa  869    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  33.82 
 
 
1127 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  30.07 
 
 
1099 aa  489  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  30.89 
 
 
1109 aa  396  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  31.81 
 
 
1122 aa  390  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  29.52 
 
 
1117 aa  334  4e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  28.54 
 
 
1125 aa  322  3e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  28.15 
 
 
1016 aa  293  9e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  28 
 
 
1160 aa  289  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  27.43 
 
 
1128 aa  269  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  27.32 
 
 
1131 aa  254  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  27.42 
 
 
1124 aa  254  5.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  25.74 
 
 
1143 aa  248  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  25.2 
 
 
1086 aa  243  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  27.69 
 
 
853 aa  242  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  26.2 
 
 
1100 aa  241  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  26.29 
 
 
1153 aa  238  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  25.9 
 
 
1109 aa  233  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  25.41 
 
 
1140 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  25.88 
 
 
1083 aa  193  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.51 
 
 
1085 aa  192  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  26.14 
 
 
1112 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  26.39 
 
 
1065 aa  191  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  27.97 
 
 
1053 aa  188  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  26.07 
 
 
1067 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  27.1 
 
 
1065 aa  179  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  28.37 
 
 
1153 aa  169  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  27.82 
 
 
1075 aa  168  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  26.84 
 
 
1075 aa  168  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  26.9 
 
 
1075 aa  168  5e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  25.68 
 
 
1082 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  27.82 
 
 
1074 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  23.72 
 
 
1089 aa  163  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  26.05 
 
 
1090 aa  161  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  25.11 
 
 
1087 aa  157  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  25.23 
 
 
1072 aa  157  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  25.96 
 
 
1077 aa  156  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  27.39 
 
 
1064 aa  154  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  24.82 
 
 
1077 aa  153  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  24.11 
 
 
1081 aa  152  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  25.03 
 
 
1077 aa  149  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  24.75 
 
 
1078 aa  149  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  25.61 
 
 
1065 aa  149  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  24.69 
 
 
1071 aa  148  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  25.2 
 
 
1069 aa  145  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  27.05 
 
 
1078 aa  145  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  25.23 
 
 
1060 aa  145  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  26.36 
 
 
963 aa  125  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  27.18 
 
 
947 aa  125  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  23.08 
 
 
1065 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  23.08 
 
 
1065 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  24.75 
 
 
949 aa  116  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  26.06 
 
 
942 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  25.16 
 
 
932 aa  111  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  25.22 
 
 
967 aa  108  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  24.24 
 
 
929 aa  107  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  24.84 
 
 
966 aa  105  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  22.61 
 
 
669 aa  105  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  25.04 
 
 
1172 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  25.97 
 
 
1147 aa  102  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  25.24 
 
 
960 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  25.49 
 
 
1168 aa  100  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  25.93 
 
 
915 aa  98.6  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  25.93 
 
 
916 aa  98.6  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  24.26 
 
 
1194 aa  97.8  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  24.87 
 
 
1170 aa  96.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  24.75 
 
 
1169 aa  96.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  23.55 
 
 
1170 aa  96.3  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  25.25 
 
 
915 aa  95.9  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  24.67 
 
 
971 aa  95.5  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  23.49 
 
 
1167 aa  95.5  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  25.68 
 
 
696 aa  95.5  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  24.63 
 
 
1116 aa  94.7  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  24.31 
 
 
1169 aa  92.8  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  23 
 
 
1170 aa  91.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  23.17 
 
 
1170 aa  91.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  24.23 
 
 
1129 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  23.64 
 
 
1172 aa  89.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  24.61 
 
 
1046 aa  89.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  23.45 
 
 
969 aa  89.4  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  29.44 
 
 
889 aa  88.2  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  24.19 
 
 
1160 aa  88.2  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1937  helicase, putative  25.08 
 
 
1062 aa  87.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000134724 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  21.84 
 
 
1095 aa  87.4  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  34.73 
 
 
541 aa  87.4  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  29.96 
 
 
813 aa  86.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.66 
 
 
961 aa  86.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  24.18 
 
 
1201 aa  86.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  24.18 
 
 
1201 aa  86.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  22.94 
 
 
1167 aa  86.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  22.93 
 
 
969 aa  85.9  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  24.26 
 
 
952 aa  85.9  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  30.98 
 
 
1043 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  24.87 
 
 
1138 aa  85.1  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  29.89 
 
 
963 aa  85.1  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  30.74 
 
 
584 aa  84  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>