More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1947 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  100 
 
 		 1099 aa  2229    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  39.44 
 
 		 1127 aa  759    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  34.38 
 
 		 1160 aa  504  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  34.41 
 
 		 1086 aa  501  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  32.96 
 
 		 1052 aa  487  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  32.8 
 
 		 1051 aa  475  1e-132  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  30.26 
 
 		 1080 aa  475  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  30.85 
 
 		 1086 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  29.07 
 
 		 1109 aa  308  4.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  27.86 
 
 		 1125 aa  301  4e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  28.8 
 
 		 1117 aa  278  4e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  28.53 
 
 		 1122 aa  275  3e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  25.52 
 
 		 1124 aa  237  8e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  25.66 
 
 		 1016 aa  226  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  24.54 
 
 		 1143 aa  204  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  23.65 
 
 		 1153 aa  192  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  24.52 
 
 		 1128 aa  191  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  24.77 
 
 		 1131 aa  185  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  25.27 
 
 		 1112 aa  178  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  23.95 
 
 		 1085 aa  176  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  25.17 
 
 		 1083 aa  170  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  23.68 
 
 		 1109 aa  170  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  24.08 
 
 		 1067 aa  169  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  23.98 
 
 		 1100 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  26.8 
 
 		 1065 aa  166  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  24.46 
 
 		 1089 aa  165  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  26.15 
 
 		 1053 aa  161  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  27.17 
 
 		 1082 aa  160  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  24.7 
 
 		 1077 aa  155  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  24.29 
 
 		 1081 aa  151  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  25.54 
 
 		 1064 aa  149  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  27.96 
 
 		 1075 aa  149  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  22.85 
 
 		 853 aa  148  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  25.94 
 
 		 1090 aa  145  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  24.65 
 
 		 1078 aa  144  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  25.14 
 
 		 1077 aa  142  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  26.46 
 
 		 1075 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1065 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  26.31 
 
 		 1078 aa  140  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  23.05 
 
 		 1071 aa  140  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  24.13 
 
 		 1069 aa  139  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  22.91 
 
 		 1140 aa  137  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  26.99 
 
 		 1075 aa  137  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  25.03 
 
 		 1065 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  23.66 
 
 		 1077 aa  134  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  24.02 
 
 		 1072 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  25.08 
 
 		 1147 aa  126  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  24.34 
 
 		 1074 aa  124  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  25.16 
 
 		 1138 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  24.34 
 
 		 1087 aa  123  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  22.72 
 
 		 1060 aa  122  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  24.88 
 
 		 1172 aa  118  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  25.12 
 
 		 951 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  23.97 
 
 		 1170 aa  116  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  22.96 
 
 		 971 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  25.19 
 
 		 1167 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  25.44 
 
 		 1136 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  22.22 
 
 		 988 aa  112  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  24.07 
 
 		 1167 aa  112  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  24.58 
 
 		 1013 aa  111  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  25.16 
 
 		 1172 aa  111  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  22.65 
 
 		 1160 aa  110  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  24.57 
 
 		 1116 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  23.09 
 
 		 1145 aa  108  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  25.64 
 
 		 835 aa  105  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1144 aa  105  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  23.4 
 
 		 1170 aa  105  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  23.58 
 
 		 949 aa  104  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  24.37 
 
 		 1062 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  24.04 
 
 		 1169 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  23.47 
 
 		 975 aa  103  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  25.91 
 
 		 1086 aa  102  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  23.42 
 
 		 1065 aa  102  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  23.42 
 
 		 1065 aa  102  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  23.73 
 
 		 1169 aa  102  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.44 
 
 		 961 aa  101  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  24.71 
 
 		 1153 aa  99  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  36.08 
 
 		 774 aa  97.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  23.23 
 
 		 1082 aa  97.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  24.11 
 
 		 665 aa  95.9  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  21.81 
 
 		 941 aa  94.7  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  21.81 
 
 		 941 aa  94.7  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  34.68 
 
 		 1167 aa  93.2  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  33.53 
 
 		 1194 aa  92.8  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  24.1 
 
 		 921 aa  93.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  22.33 
 
 		 960 aa  92.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  32.23 
 
 		 1160 aa  92  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  32.56 
 
 		 1170 aa  92  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  25 
 
 		 966 aa  91.7  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  26.62 
 
 		 969 aa  91.7  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  32.51 
 
 		 1170 aa  91.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  29.34 
 
 		 906 aa  91.3  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  23.2 
 
 		 915 aa  90.1  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  23.11 
 
 		 915 aa  90.1  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  23.2 
 
 		 916 aa  90.1  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  34.39 
 
 		 1137 aa  88.2  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  26.84 
 
 		 1187 aa  88.2  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  32.73 
 
 		 760 aa  87.8  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  24.54 
 
 		 947 aa  87.4  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  22.85 
 
 		 949 aa  87.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>