205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3360 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
161 aa  332  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  45.3 
 
 
159 aa  97.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  40.16 
 
 
135 aa  97.1  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  40.16 
 
 
135 aa  97.1  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  44.64 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2042  hypothetical protein  35.37 
 
 
165 aa  87.4  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  43.8 
 
 
152 aa  84  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  38.33 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  41.32 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  39.34 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  39.17 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  36.28 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  43.21 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  38.84 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4877  thioesterase superfamily protein  37.74 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 
232 aa  64.7  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  35.42 
 
 
191 aa  63.9  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1683  thioesterase superfamily protein  39.78 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.083684  normal  0.174772 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  35.71 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  37.17 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
191 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  37.08 
 
 
179 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  37.08 
 
 
179 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
122 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  34.83 
 
 
189 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 
174 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 
154 aa  58.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  29.05 
 
 
159 aa  58.2  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  37.11 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  37.11 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  36.73 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  38.82 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  35 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  36.17 
 
 
169 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  32.52 
 
 
209 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  39.19 
 
 
140 aa  54.3  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  33.93 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  38.38 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  36.26 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  40.23 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  37.65 
 
 
126 aa  52.4  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 
144 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  34.07 
 
 
185 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  34.26 
 
 
144 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 
160 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  31.25 
 
 
137 aa  52.4  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  29.55 
 
 
182 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  28.19 
 
 
139 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  35.71 
 
 
165 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
142 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  28.12 
 
 
147 aa  51.2  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  34.69 
 
 
143 aa  51.2  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  31 
 
 
135 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  30.36 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
142 aa  50.8  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  31.9 
 
 
176 aa  50.8  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
161 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  35.45 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
148 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  28.67 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  30.07 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  31.11 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  35.71 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  28.95 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  29.2 
 
 
138 aa  49.3  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
135 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  29.57 
 
 
127 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  36.07 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
167 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
184 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  36.47 
 
 
126 aa  48.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3386  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
142 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.220189 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  28.72 
 
 
156 aa  47.8  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  27.97 
 
 
135 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  33.71 
 
 
144 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  34.4 
 
 
167 aa  47.4  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  24.65 
 
 
156 aa  47.4  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  32.98 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.01 
 
 
176 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>