More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2129 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  298  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  44.68 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  45.65 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 178 aa  117  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 190 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  37.96 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 172 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  39.04 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 174 aa  98.2  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 161 aa  97.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 172 aa  93.6  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 176 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 315 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 172 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 179 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 184 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 188 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  54.32 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 176 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 175 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  55 
 
 		 185 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 189 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  40.44 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 170 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 141 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  27.94 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  27.94 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  27.94 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  27.94 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  27.94 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  29.69 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  29.17 
 
 		 287 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  30.08 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  35.14 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 169 aa  63.5  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 303 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  31.34 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3140  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137854  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  31.82 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>