249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6682 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 212 aa  430  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  87.17 
 
 		 189 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  83.6 
 
 		 211 aa  330  8e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  81.63 
 
 		 243 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  80.81 
 
 		 211 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  82.35 
 
 		 217 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  82.35 
 
 		 217 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  82.35 
 
 		 217 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  79.79 
 
 		 223 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  78.79 
 
 		 211 aa  318  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4618  isochorismatase hydrolase  81.18 
 
 		 218 aa  314  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  79.68 
 
 		 189 aa  308  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  75.54 
 
 		 189 aa  304  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  75.54 
 
 		 189 aa  304  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  40.1 
 
 		 195 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  38.5 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  38.38 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  38.07 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4146  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0661023  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  36.16 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  36.08 
 
 		 198 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0155  hypothetical protein  41.79 
 
 		 135 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586581  normal  0.969052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 		 174 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  29.41 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  29.88 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  29.88 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  26.87 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  31.48 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  27.88 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  26.94 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  30.46 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  42.25 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  24.7 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  37.37 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  29.7 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  26.23 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  31.2 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  36.19 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  32.72 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  25.12 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  29.45 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  37.88 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  25.7 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  25.82 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  30.41 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  40 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  27.74 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  40 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  25.89 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  26.4 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  30.07 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  26.49 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  24.64 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  35.35 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  28.4 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  25.28 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  25.28 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  32.89 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  25.28 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  25.28 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  25.28 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  33.09 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  32.17 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  33.08 
 
 		 278 aa  52.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  27.63 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  28.57 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  27.42 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  27.32 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  35.9 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  28.07 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  28.66 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  35.9 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>