284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07450 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 464 aa  939    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  44.07 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  43.34 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1639  extracellular solute-binding protein family 1  42.86 
 
 		 463 aa  359  6e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.102178  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1773  extracellular solute-binding protein family 1  42.37 
 
 		 465 aa  350  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.504545  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2819  extracellular solute-binding protein family 1  41.63 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  35.41 
 
 		 434 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.1 
 
 		 442 aa  223  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 		 460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  27.38 
 
 		 427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  26.65 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 418 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 453 aa  109  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 420 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.91 
 
 		 426 aa  104  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.88 
 
 		 416 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.13 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.46 
 
 		 453 aa  97.8  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 425 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.21 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  21.46 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.23 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  29.69 
 
 		 497 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  31.79 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  23.48 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07110  carbohydrate-binding protein  27.04 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  20.29 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.7 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 444 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11510  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.23 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.54 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.62 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.62 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3941  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.33 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.57 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.05 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0894  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.444762  normal  0.144357 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  22.74 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  23.23 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  30.34 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01220  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.54 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  22.32 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2313  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 901 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.32 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  22.34 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  28.57 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.54 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15060  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.97 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.138683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  22.34 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  22.43 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 437 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2315  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 925 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>