228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2453 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  83.01 
 
 
324 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  81 
 
 
333 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  92.77 
 
 
309 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  92.77 
 
 
309 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  57.48 
 
 
285 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  55.86 
 
 
292 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  56.52 
 
 
285 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  29.48 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0479  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  30.18 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3493  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234814  normal  0.110605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  29.52 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  28.72 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
326 aa  63.2  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 
562 aa  62.4  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  27.18 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  28.79 
 
 
979 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.01 
 
 
810 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0032  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
1445 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.3 
 
 
887 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.07 
 
 
282 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  32.69 
 
 
271 aa  59.3  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 
1838 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  29.06 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  27.91 
 
 
278 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 
878 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.25 
 
 
622 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.45 
 
 
264 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  28.19 
 
 
281 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 
352 aa  56.6  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.52 
 
 
283 aa  55.8  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
934 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 
968 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  29.92 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  29.03 
 
 
278 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  28.51 
 
 
440 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 
1737 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
1486 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
1534 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.84 
 
 
816 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.99 
 
 
764 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
282 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
3145 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 
215 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
542 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  31.07 
 
 
594 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
377 aa  52.8  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0887  Tetratricopeptide domain protein  23.12 
 
 
1339 aa  52.4  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.102317 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 
4079 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25.38 
 
 
732 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.6 
 
 
266 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.22 
 
 
676 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
727 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  31.47 
 
 
837 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.1 
 
 
512 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 
221 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 
1096 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  30.39 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 
3301 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1186  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 
1197 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 
3172 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.18 
 
 
725 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 
374 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
1406 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
1094 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4222  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
1757 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  24.88 
 
 
955 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
750 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  30.36 
 
 
725 aa  49.7  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
475 aa  49.7  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 
789 aa  49.7  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.58 
 
 
626 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 
737 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.58 
 
 
626 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 
909 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
614 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
614 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.58 
 
 
614 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
614 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.58 
 
 
614 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 
502 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
685 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 
502 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.66 
 
 
1154 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  20.32 
 
 
448 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
502 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
739 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.79 
 
 
566 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.79 
 
 
565 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 
448 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.86 
 
 
545 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
673 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 
189 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>