105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2709 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2709  regulatory protein TetR  100 
 
 		 192 aa  368  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  39.61 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  31.71 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  34.59 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  29.44 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  29.52 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  26.55 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  36 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 226 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  51.2  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 261 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  30.51 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  30.13 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 216 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 237 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  28.03 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  31.06 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  32.6 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 227 aa  45.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 225 aa  44.7  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 188 aa  44.7  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 237 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  42 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  30.17 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  42 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  42 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  32.93 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 278 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  29.1 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 268 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  45.24 
 
 		 319 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 243 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 225 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1631  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 190 aa  42  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0987628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  30.93 
 
 		 250 aa  42  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 234 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 263 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>