More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1436 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2424  homocitrate synthase  99.47 
 
 		 376 aa  755    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.965595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1436  homocitrate synthase  100 
 
 		 376 aa  758    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2393  homocitrate synthase  84.84 
 
 		 376 aa  679    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.310246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2511  homocitrate synthase  99.47 
 
 		 376 aa  755    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365846  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1257  homocitrate synthase  58.24 
 
 		 389 aa  461  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.943994  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2761  homocitrate synthase  57.37 
 
 		 391 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.258866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0947  homocitrate synthase  51.6 
 
 		 384 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01990  homocitrate synthase, mitochondrial precursor (Eurofung)  52.16 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_006686  CND01200  homocitrate synthase, putative  52.82 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742854  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89386  homocitrate synthase  50 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28701  homocitrate synthase  50.81 
 
 		 451 aa  398  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.453642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3301  pyruvate carboxyltransferase  52.96 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0533542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3603  pyruvate carboxyltransferase  51.64 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  37.78 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  33.98 
 
 		 514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  35.79 
 
 		 460 aa  213  3.9999999999999995e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  32.63 
 
 		 393 aa  205  9e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  35.79 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  33.69 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  34.06 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  33.78 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  34.68 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  33.15 
 
 		 382 aa  202  9e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  32.87 
 
 		 514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  33.33 
 
 		 388 aa  200  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  33.33 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  32.7 
 
 		 386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  33.7 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  32.31 
 
 		 514 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  32.31 
 
 		 514 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  31.82 
 
 		 383 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  32.87 
 
 		 514 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  34.37 
 
 		 475 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  34.7 
 
 		 489 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  34.41 
 
 		 406 aa  196  6e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  33.33 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  34.46 
 
 		 376 aa  193  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  32.96 
 
 		 492 aa  192  9e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  32.14 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  30.68 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  32.39 
 
 		 492 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  32 
 
 		 383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  32.68 
 
 		 492 aa  190  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  33.69 
 
 		 389 aa  190  5e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  33.9 
 
 		 393 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  32.21 
 
 		 387 aa  189  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  32.15 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  30.86 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  35.75 
 
 		 378 aa  188  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  33.88 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  34.08 
 
 		 522 aa  187  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  31.83 
 
 		 492 aa  186  6e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  34.44 
 
 		 448 aa  183  3e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  34.18 
 
 		 448 aa  183  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  31.34 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  34.44 
 
 		 490 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  31.74 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  30.9 
 
 		 485 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  34.27 
 
 		 500 aa  181  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  33.52 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  30.14 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  29.01 
 
 		 492 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  33.52 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  33.14 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  29.78 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  32.1 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  31.01 
 
 		 378 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  33.91 
 
 		 479 aa  176  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  30.09 
 
 		 381 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  30.03 
 
 		 380 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  33.7 
 
 		 521 aa  175  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  31.71 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  31.23 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  31.65 
 
 		 500 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  34.08 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  33.06 
 
 		 520 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  31.42 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  32.14 
 
 		 383 aa  173  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  30.86 
 
 		 381 aa  173  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  32.03 
 
 		 382 aa  173  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2787  2-isopropylmalate synthase  31.17 
 
 		 394 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  30.84 
 
 		 377 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  31.67 
 
 		 515 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  30.45 
 
 		 505 aa  171  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  32.23 
 
 		 508 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2032  2-isopropylmalate synthase  31.61 
 
 		 390 aa  170  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0743  2-isopropylmalate synthase/homocitrate synthase family protein  32.09 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  28.72 
 
 		 503 aa  170  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  30.55 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  32.31 
 
 		 515 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  31.11 
 
 		 392 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  31.38 
 
 		 377 aa  169  6e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  30.66 
 
 		 505 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  31.32 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  30.96 
 
 		 536 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1102  2-isopropylmalate synthase/homocitrate synthase family protein  31 
 
 		 526 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  32.12 
 
 		 516 aa  167  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  33.22 
 
 		 442 aa  166  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  34.25 
 
 		 496 aa  166  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  32.11 
 
 		 509 aa  166  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>