109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1103 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  100 
 
 		 808 aa  1581    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0065  SMC domain protein  25.4 
 
 		 985 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  33.7 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  26.79 
 
 		 892 aa  58.9  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  42.59 
 
 		 875 aa  56.6  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  39.78 
 
 		 687 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0450  SMC domain protein  26.32 
 
 		 877 aa  54.7  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  27.66 
 
 		 1051 aa  54.7  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  26.44 
 
 		 874 aa  54.3  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  25.86 
 
 		 874 aa  53.9  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5100  SMC domain protein  41.18 
 
 		 676 aa  53.9  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.797675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  26.27 
 
 		 881 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2963  DNA repair ATPase-like protein  46 
 
 		 929 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  25.24 
 
 		 844 aa  52.4  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  38.96 
 
 		 796 aa  52  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2709  SMC domain protein  31.08 
 
 		 1036 aa  51.6  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1420  hypothetical protein  33.8 
 
 		 874 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0173  hypothetical protein  39.22 
 
 		 729 aa  49.7  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  27.2 
 
 		 758 aa  50.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  27.2 
 
 		 758 aa  50.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  45.65 
 
 		 1198 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  32.38 
 
 		 581 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  42.22 
 
 		 1204 aa  49.3  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  45.65 
 
 		 1198 aa  49.3  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4566  ATPase involved in DNA repair  26.32 
 
 		 1059 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  34.94 
 
 		 1146 aa  48.5  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  27.93 
 
 		 741 aa  48.5  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4583  RecF/RecN/SMC N domain, putative  33.33 
 
 		 875 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4388  SMC domain-containing protein  31.5 
 
 		 1041 aa  48.5  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.33249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  45.65 
 
 		 1214 aa  47.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  40.43 
 
 		 1171 aa  47.8  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  43.18 
 
 		 1194 aa  47.8  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  38.3 
 
 		 1195 aa  47.8  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  41.33 
 
 		 695 aa  47.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  38.78 
 
 		 1208 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  38.78 
 
 		 1195 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  38.78 
 
 		 1195 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  40.91 
 
 		 1165 aa  47  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  38.78 
 
 		 1195 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  40.82 
 
 		 1191 aa  47.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  43.48 
 
 		 1263 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  46.15 
 
 		 824 aa  47.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  36.99 
 
 		 1032 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  40.74 
 
 		 1194 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  42 
 
 		 1176 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  40.74 
 
 		 1199 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  41.3 
 
 		 1222 aa  46.2  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  38.3 
 
 		 1164 aa  46.6  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  45.65 
 
 		 1191 aa  46.6  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  42.55 
 
 		 1020 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  40.91 
 
 		 1188 aa  46.6  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1163 aa  47  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  35.29 
 
 		 881 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  46.15 
 
 		 824 aa  47  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  36.73 
 
 		 1234 aa  47  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  28.63 
 
 		 890 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  42.22 
 
 		 1176 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1580  SMC domain protein  42.86 
 
 		 818 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.338996  normal  0.282314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  42.22 
 
 		 1176 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  37.66 
 
 		 1291 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  43.48 
 
 		 1191 aa  47  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  30.77 
 
 		 255 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  37.78 
 
 		 1168 aa  45.8  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  40.91 
 
 		 1194 aa  45.8  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  40.91 
 
 		 1194 aa  45.8  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  29.17 
 
 		 1165 aa  46.2  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  43.18 
 
 		 1213 aa  45.8  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  36.96 
 
 		 1204 aa  45.4  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  43.48 
 
 		 1192 aa  45.8  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  40.91 
 
 		 1217 aa  45.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001283  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  37.89 
 
 		 261 aa  45.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00428043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  30.36 
 
 		 879 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1385  SMC protein-like protein  33.71 
 
 		 1091 aa  45.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  38.78 
 
 		 1219 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  38.3 
 
 		 1144 aa  45.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  40.91 
 
 		 1205 aa  45.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  36.73 
 
 		 1153 aa  45.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  46.81 
 
 		 1198 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  42.86 
 
 		 891 aa  45.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  35.56 
 
 		 1170 aa  45.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  38.3 
 
 		 1190 aa  44.7  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  40.91 
 
 		 805 aa  45.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  34 
 
 		 1207 aa  45.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  39.13 
 
 		 1185 aa  44.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  36.96 
 
 		 1192 aa  45.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  41.3 
 
 		 1189 aa  44.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1224 aa  44.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  45.24 
 
 		 1179 aa  44.7  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  44.9 
 
 		 1099 aa  44.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  34.69 
 
 		 1217 aa  44.7  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  43.48 
 
 		 1188 aa  44.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  36.96 
 
 		 1195 aa  44.3  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  38.64 
 
 		 1181 aa  44.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  34.69 
 
 		 1226 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  39.34 
 
 		 1115 aa  44.7  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  38.64 
 
 		 1203 aa  44.7  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  36.73 
 
 		 1227 aa  44.3  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  38.18 
 
 		 995 aa  44.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  38.64 
 
 		 1186 aa  44.3  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  34.69 
 
 		 1226 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>