More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1385 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1385  SMC protein-like protein  100 
 
 		 1091 aa  2005    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.02 
 
 		 1185 aa  313  7.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.37 
 
 		 1199 aa  305  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  29.95 
 
 		 1179 aa  304  8.000000000000001e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.29 
 
 		 1199 aa  303  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  32.11 
 
 		 1199 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  29 
 
 		 1173 aa  292  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  29.11 
 
 		 1176 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  25.02 
 
 		 1185 aa  277  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  30.42 
 
 		 1162 aa  276  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  26.36 
 
 		 1204 aa  269  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  24.23 
 
 		 1178 aa  260  8e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  28.87 
 
 		 1167 aa  253  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  28.79 
 
 		 1167 aa  253  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.47 
 
 		 1181 aa  250  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  27.21 
 
 		 1171 aa  243  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  27.84 
 
 		 1198 aa  242  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  23.8 
 
 		 1164 aa  241  6.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  27.96 
 
 		 1268 aa  239  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  26.08 
 
 		 1191 aa  237  9e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  26.56 
 
 		 1171 aa  232  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  23.03 
 
 		 1172 aa  231  7e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  20.42 
 
 		 1174 aa  218  5e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  27.51 
 
 		 1150 aa  203  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  27.51 
 
 		 1150 aa  202  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  27.57 
 
 		 1177 aa  187  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  44 
 
 		 1174 aa  184  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  45.5 
 
 		 1188 aa  184  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  35.6 
 
 		 1188 aa  179  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  37.91 
 
 		 1217 aa  179  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  35.6 
 
 		 1188 aa  179  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  31.82 
 
 		 1189 aa  177  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  32 
 
 		 1191 aa  177  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  28.78 
 
 		 1191 aa  176  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  33.24 
 
 		 1189 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  38.63 
 
 		 1263 aa  176  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  40.81 
 
 		 1218 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  31.29 
 
 		 1222 aa  175  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  33.52 
 
 		 1187 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  40.54 
 
 		 1194 aa  174  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  32.03 
 
 		 1189 aa  174  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  32.97 
 
 		 1189 aa  174  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  40.09 
 
 		 1195 aa  174  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  29.73 
 
 		 1196 aa  173  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  40.09 
 
 		 1195 aa  174  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  44 
 
 		 1214 aa  173  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  38.46 
 
 		 1205 aa  173  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29.7 
 
 		 1184 aa  173  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  40.19 
 
 		 1189 aa  172  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  40.19 
 
 		 1189 aa  172  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  40.19 
 
 		 1189 aa  172  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  40.19 
 
 		 1189 aa  172  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  40.19 
 
 		 1189 aa  172  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  40.65 
 
 		 1189 aa  172  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1191 aa  172  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  40.65 
 
 		 1189 aa  172  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  40.65 
 
 		 1189 aa  172  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  24.83 
 
 		 1185 aa  172  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  41.44 
 
 		 1222 aa  172  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  40.54 
 
 		 1203 aa  171  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  39.01 
 
 		 1183 aa  171  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  38.98 
 
 		 1184 aa  170  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  31.79 
 
 		 1190 aa  170  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  40.09 
 
 		 1198 aa  170  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  31.15 
 
 		 1198 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  36.23 
 
 		 1186 aa  170  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  43 
 
 		 1172 aa  169  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  39.91 
 
 		 1227 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  39.64 
 
 		 1198 aa  169  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  26.72 
 
 		 1301 aa  168  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  43.52 
 
 		 1201 aa  168  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  37.87 
 
 		 1185 aa  168  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  40.36 
 
 		 1188 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  40.57 
 
 		 1181 aa  167  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  40.36 
 
 		 1224 aa  167  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  29.15 
 
 		 1186 aa  167  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  39.64 
 
 		 1194 aa  167  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  43 
 
 		 1213 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  30 
 
 		 1180 aa  167  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  36.63 
 
 		 1177 aa  167  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  40.29 
 
 		 1190 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  29.24 
 
 		 1169 aa  166  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  39.22 
 
 		 1225 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  29.03 
 
 		 1169 aa  166  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  40.38 
 
 		 1186 aa  166  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  42.29 
 
 		 1217 aa  166  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  37.45 
 
 		 1185 aa  166  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  39.74 
 
 		 1179 aa  165  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  33.67 
 
 		 1255 aa  165  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  30.67 
 
 		 1187 aa  164  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  31.52 
 
 		 1175 aa  164  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  31.66 
 
 		 1148 aa  164  7e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  44.03 
 
 		 1187 aa  164  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  42.59 
 
 		 1200 aa  163  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  28.66 
 
 		 1176 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  28.37 
 
 		 1178 aa  163  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  39.01 
 
 		 1188 aa  162  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  38.67 
 
 		 1191 aa  162  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  32.21 
 
 		 980 aa  161  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  32.5 
 
 		 1198 aa  160  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>