More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0602 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  72.16 
 
 		 746 aa  1149    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  56.77 
 
 		 760 aa  874    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  57.56 
 
 		 760 aa  885    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 747 aa  1532    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 815 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 782 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.36 
 
 		 766 aa  271  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 786 aa  245  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 828 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 798 aa  211  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 736 aa  204  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 729 aa  191  4e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 841 aa  187  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 753 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 781 aa  176  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 772 aa  167  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 777 aa  161  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 768 aa  160  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 796 aa  151  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 792 aa  144  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 791 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  25.35 
 
 		 768 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 799 aa  140  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 768 aa  138  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 765 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 780 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 747 aa  134  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 754 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 754 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 777 aa  127  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 762 aa  126  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 786 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  22.71 
 
 		 740 aa  109  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 742 aa  107  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 790 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  25.27 
 
 		 740 aa  94.4  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 835 aa  91.7  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 766 aa  87.4  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 738 aa  86.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  23.2 
 
 		 708 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 738 aa  86.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 782 aa  85.9  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 727 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  25.66 
 
 		 741 aa  85.5  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  25.93 
 
 		 734 aa  85.1  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 727 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 793 aa  81.3  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  25.55 
 
 		 730 aa  80.9  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.4 
 
 		 724 aa  79.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 756 aa  80.1  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  23.94 
 
 		 792 aa  78.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.46 
 
 		 713 aa  77.4  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.46 
 
 		 713 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  21.12 
 
 		 772 aa  76.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 781 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 773 aa  76.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  22.1 
 
 		 705 aa  76.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 700 aa  75.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 		 814 aa  74.7  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 735 aa  74.7  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 735 aa  74.7  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  21.29 
 
 		 693 aa  74.3  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 700 aa  73.9  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  26.25 
 
 		 700 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 709 aa  73.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  21.46 
 
 		 774 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  26.25 
 
 		 700 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 712 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 700 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 700 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 700 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 700 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1883  TonB-dependent receptor  20.76 
 
 		 702 aa  72  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.08 
 
 		 728 aa  72  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 715 aa  71.6  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 700 aa  70.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0336  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 740 aa  70.9  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 795 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 709 aa  70.9  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  21.17 
 
 		 774 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  21.17 
 
 		 774 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 700 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  21.17 
 
 		 774 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  25.27 
 
 		 689 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  23.71 
 
 		 713 aa  70.1  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 795 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  20.88 
 
 		 774 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 721 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  23.51 
 
 		 737 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 742 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 810 aa  68.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 		 730 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  31.37 
 
 		 656 aa  68.9  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 751 aa  68.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 702 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 702 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 737 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  25.27 
 
 		 706 aa  67.8  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  25.27 
 
 		 706 aa  67.8  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 736 aa  67.8  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>