More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0336 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0336  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 740 aa  1525    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 711 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.74 
 
 		 708 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 828 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 708 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  23.98 
 
 		 703 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 708 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  24.55 
 
 		 709 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 701 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 		 709 aa  133  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  23.24 
 
 		 692 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 710 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.66 
 
 		 711 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 710 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.65 
 
 		 703 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 757 aa  129  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 713 aa  129  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 806 aa  128  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  25.74 
 
 		 715 aa  127  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 753 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  24.66 
 
 		 689 aa  127  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  23.48 
 
 		 808 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 789 aa  125  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  24.01 
 
 		 703 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 745 aa  124  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 705 aa  124  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 794 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  25 
 
 		 801 aa  122  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.87 
 
 		 689 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 820 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 710 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  22.27 
 
 		 837 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 797 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  24.31 
 
 		 722 aa  118  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  22.97 
 
 		 696 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 696 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 714 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  24.26 
 
 		 753 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  23.02 
 
 		 817 aa  115  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.87 
 
 		 706 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  23.69 
 
 		 808 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  23.47 
 
 		 729 aa  114  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  23.65 
 
 		 860 aa  114  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 		 850 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  24.12 
 
 		 750 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 778 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 696 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  25.45 
 
 		 696 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 722 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  24.1 
 
 		 729 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 733 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 701 aa  112  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  23.94 
 
 		 744 aa  112  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 729 aa  111  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 710 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 715 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  24.4 
 
 		 705 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  23.86 
 
 		 744 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  24.1 
 
 		 828 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  23.71 
 
 		 741 aa  109  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  24.17 
 
 		 828 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  24.53 
 
 		 737 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 792 aa  109  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 736 aa  109  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  25.21 
 
 		 698 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  24.05 
 
 		 752 aa  109  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  23.78 
 
 		 741 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6351  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 725 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532557  normal  0.487523 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 		 724 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  23.78 
 
 		 752 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  23.03 
 
 		 735 aa  108  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  23.78 
 
 		 736 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  23.78 
 
 		 736 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  23.58 
 
 		 697 aa  108  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  23.41 
 
 		 701 aa  108  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6529  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 		 725 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6763  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 		 725 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  24.39 
 
 		 753 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  24.38 
 
 		 747 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  24.12 
 
 		 738 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  24.39 
 
 		 753 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 817 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 750 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 		 710 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  24.13 
 
 		 723 aa  107  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  23.24 
 
 		 712 aa  107  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 724 aa  107  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  24.96 
 
 		 696 aa  107  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 		 770 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  25.49 
 
 		 799 aa  106  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  23.6 
 
 		 828 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  23.41 
 
 		 754 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  22.83 
 
 		 745 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  24.57 
 
 		 723 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 734 aa  106  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  22.86 
 
 		 729 aa  106  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  23.41 
 
 		 754 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  24.06 
 
 		 747 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  23.86 
 
 		 724 aa  106  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  23.41 
 
 		 754 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>