More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6514 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 278 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  86.69 
 
 		 278 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  61.07 
 
 		 281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  61.79 
 
 		 278 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  62.32 
 
 		 283 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1878  HpcH/HpaI aldolase  59.71 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.820651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  48.24 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  46.26 
 
 		 282 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  46.26 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  45.45 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  43.86 
 
 		 292 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  47.29 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  45.05 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0293  HpcH/HpaI aldolase  48.94 
 
 		 291 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0092  HpcH/HpaI aldolase  42.07 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5821  HpcH/HpaI aldolase  40.35 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.577572  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2314  citrate (pro-3S)-lyase  49.47 
 
 		 289 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1255  Citrate (pro-3S)-lyase  41.61 
 
 		 289 aa  175  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.0181011 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  39.93 
 
 		 276 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  38.97 
 
 		 282 aa  168  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758  putative citrate lyase beta chain (acyl lyase subunit)  38.95 
 
 		 290 aa  161  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  39.19 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  39.48 
 
 		 271 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.56 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  37.24 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  41.85 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1391  HpcH/HpaI aldolase  40.28 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375922  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  38.75 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  37.18 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  38.75 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  38.75 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1409  HpcH/HpaI aldolase  39.07 
 
 		 279 aa  142  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000390566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2925  HpcH/HpaI aldolase  39.41 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.253914  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  34.51 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2104  HpcH/HpaI aldolase  41.09 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.87307  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  38.08 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  37.27 
 
 		 291 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  39.03 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  35.51 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  31.65 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  35.07 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  37.68 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  36.36 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  35.04 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  40.07 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  35.07 
 
 		 292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  34.84 
 
 		 306 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  39.1 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  37.27 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  39.46 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  33.7 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  35.34 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  37.23 
 
 		 271 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  38.52 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  37.5 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  35.84 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  33.57 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  38.3 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  33.57 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.14 
 
 		 280 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.14 
 
 		 280 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  36.14 
 
 		 280 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  35.64 
 
 		 270 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  34.39 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  36.11 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  38.68 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.75 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  33.45 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.75 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  39.21 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.75 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.75 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  37.46 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  38.43 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  34.17 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  34.17 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  34.63 
 
 		 313 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  37.23 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  35.07 
 
 		 296 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  36.13 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  37.02 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  37.55 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  33.45 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  33.69 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  35.71 
 
 		 296 aa  125  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  34.15 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  36.03 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  35.97 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  36.17 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  35.46 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  33.21 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  36.36 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  34.81 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3317  Citrate (pro-3S)-lyase  37.78 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  34.55 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  36.64 
 
 		 406 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  32.53 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3048  Citryl-CoA lyase  37.02 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  33.57 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  33.94 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.422564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>