More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0523 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 416 aa  845    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  36.86 
 
 		 420 aa  242  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  36.59 
 
 		 420 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 407 aa  234  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  31.57 
 
 		 432 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 432 aa  200  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  31.95 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 432 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  32.14 
 
 		 426 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  32.14 
 
 		 426 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  28.49 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.98 
 
 		 426 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  33.06 
 
 		 414 aa  167  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  26.57 
 
 		 435 aa  159  8e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.68 
 
 		 424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3075  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  30.58 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 428 aa  149  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 426 aa  143  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 426 aa  142  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.05 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  26.65 
 
 		 436 aa  141  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 424 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 432 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2013  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 423 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.991542  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.08 
 
 		 411 aa  112  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 444 aa  110  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 411 aa  110  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.36 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 437 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10950  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.28 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575293  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  21.73 
 
 		 434 aa  106  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 410 aa  106  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 		 449 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  37.78 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.1 
 
 		 440 aa  103  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  34.46 
 
 		 412 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.22 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  37.78 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  34.87 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 424 aa  99.8  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 419 aa  99.8  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 435 aa  98.2  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 		 411 aa  97.1  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.46 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.84 
 
 		 430 aa  95.5  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.1 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 429 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 410 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  23.26 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  23.26 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 414 aa  91.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.67 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  26.05 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 423 aa  90.1  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  27.85 
 
 		 425 aa  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 443 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  26.3 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.8 
 
 		 407 aa  87  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 456 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 441 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.78 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  27.94 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.85 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.81 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>