More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1815 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 419 aa  853    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2965  extracellular ligand-binding receptor  80.62 
 
 		 413 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.820015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  66.5 
 
 		 416 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  66.01 
 
 		 421 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4759  extracellular ligand-binding receptor  69.47 
 
 		 421 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  67.24 
 
 		 424 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4089  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  64.4 
 
 		 428 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0482  extracellular ligand-binding receptor  51.19 
 
 		 412 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1322  extracellular ligand-binding receptor  52.24 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0679703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3307  Extracellular ligand-binding receptor  31.02 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1321  Extracellular ligand-binding receptor  28.79 
 
 		 444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  31.41 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3808  Extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1254  Extracellular ligand-binding receptor  29.52 
 
 		 474 aa  132  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 		 386 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.87 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 409 aa  99.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0326  extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 		 441 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.933316  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  26.34 
 
 		 381 aa  96.7  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 		 439 aa  97.1  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0514  extracellular ligand-binding receptor  24.37 
 
 		 409 aa  96.7  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0052  Extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1310  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.2 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381196  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  26.69 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2993  hypothetical protein  30.06 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  26.06 
 
 		 389 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 		 377 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  28.87 
 
 		 384 aa  93.2  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2330  Extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  25.48 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  24.74 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 		 379 aa  90.5  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  26.39 
 
 		 376 aa  90.1  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0229  Extracellular ligand-binding receptor  27.91 
 
 		 441 aa  89.7  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00108704  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 		 396 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 		 396 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4422  extracellular ligand-binding receptor  28.34 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1524  extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 		 459 aa  89  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0533175  normal  0.466259 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 386 aa  88.2  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  24.77 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 445 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 		 376 aa  87.4  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 384 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 		 390 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  27.38 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  25.96 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  25.9 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  25.54 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  26.41 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  24.47 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  22.41 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0349  extracellular ligand-binding receptor  27.65 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0895  extracellular ligand-binding receptor  25.18 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  28.04 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  26.68 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1675  Extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0898959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  28.98 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.62 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0360  extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01985  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.28 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4434  extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  25.7 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6648  Extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0122953  normal  0.152 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2589  extracellular ligand-binding receptor  24.51 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.282343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  25.7 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  23.83 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.4 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  29.01 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  26.43 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5695  Extracellular ligand-binding receptor  27.08 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0211011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0848  extracellular ligand-binding receptor  24.2 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.762199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  25.78 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  24.06 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>