More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7655 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  52.97 
 
 		 1154 aa  965    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  52 
 
 		 1150 aa  943    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  53.34 
 
 		 1152 aa  947    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  47.7 
 
 		 1153 aa  723    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1148 aa  2118    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  56.83 
 
 		 1151 aa  996    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  48.06 
 
 		 1150 aa  728    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  50.82 
 
 		 1168 aa  936    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  53.48 
 
 		 1153 aa  960    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  52.23 
 
 		 1153 aa  918    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  48.04 
 
 		 1167 aa  723    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  51.79 
 
 		 1154 aa  975    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  45.16 
 
 		 1151 aa  776    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  52.13 
 
 		 1154 aa  989    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  51.78 
 
 		 1154 aa  958    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  51 
 
 		 1153 aa  932    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  50.82 
 
 		 1170 aa  935    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  51.95 
 
 		 1154 aa  974    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  55.94 
 
 		 1150 aa  910    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  53.52 
 
 		 1152 aa  952    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  52.91 
 
 		 1152 aa  972    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  51.39 
 
 		 1153 aa  918    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  48.61 
 
 		 1153 aa  847    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  42.62 
 
 		 1147 aa  592  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  77.81 
 
 		 1144 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  54.3 
 
 		 1152 aa  543  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  48.18 
 
 		 1140 aa  438  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  44.64 
 
 		 1148 aa  428  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.8 
 
 		 1176 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.84 
 
 		 1177 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.83 
 
 		 1176 aa  403  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  33.12 
 
 		 1171 aa  399  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  30.96 
 
 		 1176 aa  399  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  34.19 
 
 		 1175 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.6 
 
 		 1175 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  32.22 
 
 		 1162 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  28.74 
 
 		 1169 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  32.1 
 
 		 1162 aa  386  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  29.24 
 
 		 1169 aa  385  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  32.94 
 
 		 1174 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  32.29 
 
 		 1171 aa  386  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  32.17 
 
 		 1204 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  32.91 
 
 		 1174 aa  379  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  32.54 
 
 		 1162 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  31.97 
 
 		 1168 aa  372  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  33.79 
 
 		 1268 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1164 aa  366  1e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  31.47 
 
 		 1167 aa  365  2e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  31.62 
 
 		 1142 aa  366  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  30.53 
 
 		 1139 aa  365  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  31.39 
 
 		 1167 aa  364  6e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1164 aa  362  2e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  31.5 
 
 		 1167 aa  362  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  42.52 
 
 		 1165 aa  361  3e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.38 
 
 		 1187 aa  348  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  54.42 
 
 		 1151 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  52.62 
 
 		 1170 aa  345  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  53.87 
 
 		 1170 aa  342  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  49.18 
 
 		 1151 aa  341  4e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  26.86 
 
 		 1185 aa  342  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  26.37 
 
 		 1186 aa  334  5e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.3 
 
 		 1179 aa  324  7e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.22 
 
 		 1177 aa  322  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  59.71 
 
 		 1147 aa  318  4e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  52.49 
 
 		 1167 aa  313  9e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  44.77 
 
 		 1511 aa  287  8e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  31.42 
 
 		 1403 aa  275  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  20.55 
 
 		 1180 aa  270  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  34.84 
 
 		 1165 aa  227  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  47.83 
 
 		 1176 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.5 
 
 		 1173 aa  213  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  45.61 
 
 		 1138 aa  210  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  45.61 
 
 		 1138 aa  210  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  49.08 
 
 		 1199 aa  210  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  45.61 
 
 		 1138 aa  210  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  32.44 
 
 		 1171 aa  210  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  31.14 
 
 		 1171 aa  209  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  32.4 
 
 		 1175 aa  209  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  48.62 
 
 		 1199 aa  208  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  33.72 
 
 		 1181 aa  208  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  48.62 
 
 		 1199 aa  208  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  49.52 
 
 		 1138 aa  208  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  32.98 
 
 		 1195 aa  208  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  34.51 
 
 		 1175 aa  207  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  46.75 
 
 		 1144 aa  205  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  49.04 
 
 		 1145 aa  205  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  31.93 
 
 		 1198 aa  205  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  40.94 
 
 		 1171 aa  204  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  41.28 
 
 		 1171 aa  203  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1150 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  40.7 
 
 		 1170 aa  203  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1150 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  47.71 
 
 		 1138 aa  202  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  48.33 
 
 		 1133 aa  202  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  46.33 
 
 		 1198 aa  202  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  42.17 
 
 		 1167 aa  201  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  48.33 
 
 		 814 aa  201  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  49.04 
 
 		 1164 aa  201  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  40.55 
 
 		 1170 aa  201  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  38.24 
 
 		 1167 aa  201  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>