More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3984 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  427  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5945  regulatory protein, TetR  62.76 
 
 		 216 aa  236  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.542251  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03806  transcriptional regulator, TetR family  43.98 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3765  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0357958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 218 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  40.89 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2697  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366203  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6435  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 262 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253012  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4138  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3206  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  54.69 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  51.43 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  29.45 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  27.98 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  29.17 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  48.39 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  35.62 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  35.62 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  35.62 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 295 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  35.62 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  35.62 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 408 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  35.62 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  29.93 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  54 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 451 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 428 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 451 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  28.64 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>