113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1161 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  100 
 
 		 1902 aa  3727    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  44.97 
 
 		 2886 aa  340  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  41.46 
 
 		 1359 aa  292  5.0000000000000004e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  40.59 
 
 		 1699 aa  283  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  40.92 
 
 		 1804 aa  244  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  37.97 
 
 		 4480 aa  244  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  40.61 
 
 		 2042 aa  238  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  51.19 
 
 		 852 aa  223  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  34.35 
 
 		 2194 aa  211  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  35.7 
 
 		 1951 aa  197  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  38.78 
 
 		 2528 aa  187  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.25 
 
 		 2156 aa  186  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  36.49 
 
 		 2192 aa  180  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  37.85 
 
 		 777 aa  178  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  35 
 
 		 549 aa  174  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  35.88 
 
 		 3066 aa  169  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  30.59 
 
 		 916 aa  159  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  32.02 
 
 		 3227 aa  147  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  34.03 
 
 		 2233 aa  146  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  30.05 
 
 		 898 aa  140  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  32.06 
 
 		 5442 aa  138  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  31.63 
 
 		 913 aa  136  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  29.84 
 
 		 2839 aa  134  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  30.2 
 
 		 4830 aa  129  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1585 aa  129  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  30.2 
 
 		 3864 aa  128  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  30.74 
 
 		 7434 aa  127  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1588 aa  122  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  33.39 
 
 		 4697 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  29.7 
 
 		 899 aa  115  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1825 aa  113  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  30.96 
 
 		 918 aa  113  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  30.72 
 
 		 1196 aa  112  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  31.16 
 
 		 937 aa  109  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  39.01 
 
 		 1092 aa  100  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  28 
 
 		 3586 aa  94  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2341  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  50.49 
 
 		 757 aa  93.2  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.480473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  30.1 
 
 		 888 aa  89.4  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  35.96 
 
 		 1428 aa  87.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1526 aa  84.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  27.17 
 
 		 1424 aa  82.4  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  35.38 
 
 		 906 aa  81.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  57.97 
 
 		 1241 aa  80.5  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  41.83 
 
 		 2802 aa  78.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  29.86 
 
 		 694 aa  75.9  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  30.61 
 
 		 873 aa  75.5  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  31.23 
 
 		 790 aa  75.5  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  31.19 
 
 		 696 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  38.79 
 
 		 2831 aa  73.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  23.08 
 
 		 1332 aa  72.8  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  30.72 
 
 		 4689 aa  72  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  38.98 
 
 		 2961 aa  71.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0022  fibronectin type III domain-containing protein  27.65 
 
 		 730 aa  70.5  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0168573  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  28.49 
 
 		 846 aa  67.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  30.47 
 
 		 781 aa  67.4  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  25.43 
 
 		 5743 aa  67.4  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  26.15 
 
 		 2552 aa  66.6  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  33.45 
 
 		 2768 aa  65.9  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  30.5 
 
 		 860 aa  65.9  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  29.4 
 
 		 763 aa  65.5  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  51.89 
 
 		 1202 aa  65.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  27.31 
 
 		 2117 aa  64.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  29.62 
 
 		 1219 aa  64.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  30.27 
 
 		 770 aa  63.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  27.93 
 
 		 954 aa  63.2  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  33.74 
 
 		 768 aa  62.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  26.26 
 
 		 3925 aa  62.8  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  41.67 
 
 		 983 aa  60.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1588  Outer membrane autotransporter barrel  39.05 
 
 		 1184 aa  60.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  37.36 
 
 		 819 aa  60.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  29.77 
 
 		 777 aa  58.9  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  27.44 
 
 		 3340 aa  58.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  46.55 
 
 		 560 aa  58.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  30.37 
 
 		 6109 aa  58.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  23.65 
 
 		 1096 aa  58.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  30.33 
 
 		 4430 aa  57.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  28.4 
 
 		 1141 aa  57.4  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.93 
 
 		 1919 aa  57  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  27.7 
 
 		 1047 aa  56.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  29.72 
 
 		 756 aa  56.6  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1061 aa  56.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  40.91 
 
 		 1191 aa  55.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 913 aa  55.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  39.29 
 
 		 2239 aa  55.5  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.52 
 
 		 5216 aa  54.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  43.52 
 
 		 2927 aa  54.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  27.68 
 
 		 653 aa  53.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.78 
 
 		 3552 aa  52.4  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.35 
 
 		 1143 aa  52  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  33.78 
 
 		 764 aa  52  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  32.39 
 
 		 1762 aa  52  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  31.85 
 
 		 3562 aa  52  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  32.22 
 
 		 768 aa  51.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  31.31 
 
 		 482 aa  51.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1657 aa  50.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  29.16 
 
 		 675 aa  50.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.03 
 
 		 4106 aa  49.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  26.78 
 
 		 2447 aa  49.7  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  24.36 
 
 		 3325 aa  49.3  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  28.57 
 
 		 1222 aa  49.3  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>