97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0316 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  91.53 
 
 		 815 aa  1561    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  52.95 
 
 		 816 aa  894    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  100 
 
 		 815 aa  1682    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  26.9 
 
 		 815 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  28.01 
 
 		 809 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  26.12 
 
 		 860 aa  267  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  26.93 
 
 		 855 aa  265  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  26.67 
 
 		 874 aa  265  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  26.69 
 
 		 855 aa  263  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  26.67 
 
 		 864 aa  259  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  25.47 
 
 		 847 aa  241  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  24.55 
 
 		 864 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.38 
 
 		 868 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  26.22 
 
 		 690 aa  206  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  23.54 
 
 		 866 aa  206  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  24.27 
 
 		 865 aa  190  8e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  25.32 
 
 		 827 aa  183  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  23.51 
 
 		 875 aa  169  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  23.21 
 
 		 858 aa  164  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  28.89 
 
 		 862 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  28.89 
 
 		 862 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  28.89 
 
 		 862 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  28.89 
 
 		 862 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  28.89 
 
 		 862 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  22.91 
 
 		 862 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4218  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.57 
 
 		 894 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.750787 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.29 
 
 		 860 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  23.17 
 
 		 866 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  22.46 
 
 		 843 aa  139  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  25.41 
 
 		 841 aa  120  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.56 
 
 		 819 aa  113  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.59 
 
 		 811 aa  113  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  26.02 
 
 		 845 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  26.67 
 
 		 845 aa  102  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.94 
 
 		 792 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.88 
 
 		 837 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  26.02 
 
 		 843 aa  89.7  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  25.06 
 
 		 866 aa  82.4  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.1 
 
 		 861 aa  80.9  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.42 
 
 		 629 aa  80.1  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.15 
 
 		 629 aa  80.1  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26 
 
 		 631 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.31 
 
 		 608 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.82 
 
 		 611 aa  74.3  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.67 
 
 		 630 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  22.65 
 
 		 841 aa  66.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  20.53 
 
 		 687 aa  64.3  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  22.22 
 
 		 621 aa  63.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  23.92 
 
 		 616 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  24.02 
 
 		 814 aa  63.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  21.03 
 
 		 825 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  22.77 
 
 		 840 aa  61.6  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  22.77 
 
 		 840 aa  61.6  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  22.52 
 
 		 840 aa  61.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  22.07 
 
 		 817 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.97 
 
 		 659 aa  60.1  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.34 
 
 		 595 aa  57.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  21.2 
 
 		 811 aa  57.8  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  25.11 
 
 		 908 aa  57  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  20.32 
 
 		 816 aa  55.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  21.54 
 
 		 823 aa  55.1  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2755  hypothetical protein  24.62 
 
 		 964 aa  54.7  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446038  normal  0.940253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  22.34 
 
 		 816 aa  54.3  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  21 
 
 		 823 aa  54.3  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  22.49 
 
 		 816 aa  54.3  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  22.92 
 
 		 816 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  21.75 
 
 		 813 aa  53.5  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  21.78 
 
 		 819 aa  53.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  21.08 
 
 		 813 aa  53.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  21.85 
 
 		 952 aa  51.6  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  21.48 
 
 		 843 aa  51.2  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  23.38 
 
 		 955 aa  50.8  0.00009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.93 
 
 		 609 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  19.08 
 
 		 822 aa  50.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  20.88 
 
 		 711 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  20.43 
 
 		 495 aa  48.9  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.44 
 
 		 815 aa  48.9  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  19.46 
 
 		 815 aa  48.9  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  20.49 
 
 		 945 aa  48.5  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  21.85 
 
 		 954 aa  48.1  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  24.88 
 
 		 845 aa  48.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0794  hypothetical protein  22.92 
 
 		 805 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  20.33 
 
 		 495 aa  47  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  19.3 
 
 		 817 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  20.75 
 
 		 610 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  28.87 
 
 		 852 aa  47.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2228  conjugal transfer protein TrbE  21.84 
 
 		 854 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0444639  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  26.21 
 
 		 916 aa  45.8  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  26.21 
 
 		 916 aa  45.8  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  31.62 
 
 		 889 aa  45.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6632  conjugal transfer protein TrbE  28.17 
 
 		 852 aa  45.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  22.41 
 
 		 747 aa  45.1  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  28.21 
 
 		 954 aa  44.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6505  conjugal transfer protein TrbE  28.17 
 
 		 852 aa  45.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158384  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  18.4 
 
 		 569 aa  44.7  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.83 
 
 		 913 aa  44.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.63 
 
 		 618 aa  44.3  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>