240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0778 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 425 aa  852    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  61.54 
 
 		 410 aa  481  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  60.79 
 
 		 410 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  60.79 
 
 		 410 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  60.79 
 
 		 410 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  60.55 
 
 		 410 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  60.55 
 
 		 410 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  60.55 
 
 		 410 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 405 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  54.09 
 
 		 405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  54.78 
 
 		 389 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  57.56 
 
 		 311 aa  300  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  24.15 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  24.39 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  25.17 
 
 		 739 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 586 aa  87  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  26.44 
 
 		 558 aa  83.2  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  28 
 
 		 563 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  25.22 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 537 aa  77  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  24.05 
 
 		 740 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 553 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  34.43 
 
 		 536 aa  73.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  37.6 
 
 		 609 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  31.51 
 
 		 538 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.36 
 
 		 596 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  26.35 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  34.51 
 
 		 525 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.46 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 575 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  34.07 
 
 		 536 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  37.86 
 
 		 547 aa  70.1  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  31.08 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  20.22 
 
 		 555 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 546 aa  68.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  31.69 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  31.25 
 
 		 566 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  36.11 
 
 		 525 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  32.54 
 
 		 558 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  38.14 
 
 		 515 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  26.37 
 
 		 518 aa  66.6  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 644 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  33.81 
 
 		 616 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  28.06 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  23.96 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  25.14 
 
 		 562 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  28.92 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  33.1 
 
 		 618 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 517 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 564 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 552 aa  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  36.36 
 
 		 705 aa  63.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  28.87 
 
 		 637 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.14 
 
 		 601 aa  62.4  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 516 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  29.85 
 
 		 534 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  27.86 
 
 		 616 aa  60.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  29.17 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  28.1 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.2 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  25.5 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  26.17 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  33.9 
 
 		 665 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  32.21 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  39.02 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 597 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  33.12 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  38.24 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  27.64 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  33.61 
 
 		 585 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.63 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  26.09 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  26.64 
 
 		 614 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  25.52 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  25 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  38.37 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  29.41 
 
 		 442 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  38.3 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  34.95 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  35.24 
 
 		 645 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  30.08 
 
 		 519 aa  56.6  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  28.77 
 
 		 598 aa  56.6  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  37.97 
 
 		 648 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  23.43 
 
 		 600 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  35.83 
 
 		 557 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  29.53 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  29.51 
 
 		 505 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  20.92 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 494 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  27.98 
 
 		 741 aa  54.3  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  34.65 
 
 		 491 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>