More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0034 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0034  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  100 
 
 
728 aa  1506  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  33.13 
 
 
1079 aa  267  6e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  37.74 
 
 
663 aa  257  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.06 
 
 
668 aa  256  1e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.06 
 
 
668 aa  256  1e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  41.99 
 
 
555 aa  247  6e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  35.99 
 
 
609 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  35.71 
 
 
709 aa  241  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2333  hypothetical protein  37.96 
 
 
565 aa  235  2e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  30.35 
 
 
494 aa  223  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1155  diguanylate cyclase  37.94 
 
 
605 aa  220  9e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.290971  normal  0.125636 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  30.14 
 
 
494 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  38.21 
 
 
563 aa  214  4e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0402  diguanylate cyclase  35.25 
 
 
866 aa  206  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362695  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  34.69 
 
 
1099 aa  206  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2290  diguanylate cyclase  34.77 
 
 
646 aa  202  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.666302 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2477  hypothetical protein  41.26 
 
 
273 aa  200  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1977  membrane associated GGDEF protein  33.63 
 
 
583 aa  189  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1689  diguanylate cyclase  36.45 
 
 
574 aa  184  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2008  diguanylate cyclase  36.14 
 
 
574 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4588  diguanylate cyclase  34.6 
 
 
613 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0646445  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0825  diguanylate cyclase  34.19 
 
 
594 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1169  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.23 
 
 
596 aa  177  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  33.61 
 
 
608 aa  167  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2097  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.85 
 
 
800 aa  158  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.37 
 
 
353 aa  158  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.0214e-05  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3642  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.63 
 
 
796 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127426  normal  0.751556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  38.99 
 
 
342 aa  157  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.35 
 
 
557 aa  156  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1616  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.87 
 
 
796 aa  154  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4748  diguanylate cyclase  48.24 
 
 
377 aa  152  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1609  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.16 
 
 
796 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.248445 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1298  diguanylate cyclase  33.23 
 
 
576 aa  151  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.135306  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1750  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  26.2 
 
 
896 aa  151  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.42554 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  42.41 
 
 
457 aa  151  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  42.92 
 
 
721 aa  149  2e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  49.39 
 
 
457 aa  149  2e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.8 
 
 
675 aa  148  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  7.98179e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  38.81 
 
 
405 aa  147  7e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1425  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  30.91 
 
 
483 aa  147  8e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  46.2 
 
 
638 aa  147  8e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  46.71 
 
 
343 aa  146  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  42.05 
 
 
457 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  42.49 
 
 
457 aa  146  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.07 
 
 
550 aa  145  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  47.56 
 
 
457 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  38.82 
 
 
461 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  46.95 
 
 
457 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3476  diguanylate cyclase  39.7 
 
 
298 aa  144  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1107  two component signal transduction response regulator  44.1 
 
 
323 aa  144  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2731  diguanylate cyclase  41.24 
 
 
714 aa  143  1e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1834  diguanylate cyclase  39.55 
 
 
525 aa  143  1e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.245567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  43.23 
 
 
455 aa  143  1e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  46.34 
 
 
457 aa  142  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0241  diguanylate cyclase  36.36 
 
 
640 aa  141  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6345  diguanylate cyclase  46.93 
 
 
506 aa  142  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155718  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  44.85 
 
 
459 aa  141  4e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4131  diguanylate cyclase  35 
 
 
369 aa  141  4e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.53 
 
 
355 aa  141  4e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  5.95067e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2544  diguanylate cyclase  42.7 
 
 
398 aa  141  5e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.871243  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  45.73 
 
 
457 aa  141  5e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0362  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.52 
 
 
890 aa  141  5e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190279  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  45.12 
 
 
457 aa  141  5e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 
1073 aa  141  5e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  40.41 
 
 
457 aa  141  5e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3203  diguanylate cyclase  41.75 
 
 
569 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0987619 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.8 
 
 
916 aa  140  6e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0371  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.52 
 
 
890 aa  140  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6048  diguanylate cyclase  46.37 
 
 
506 aa  140  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.423069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  45.12 
 
 
466 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.01 
 
 
772 aa  139  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0085  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40 
 
 
301 aa  138  3e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1614  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.01 
 
 
531 aa  138  3e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.423577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.21 
 
 
454 aa  138  3e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1306  diguanylate cyclase  30.49 
 
 
615 aa  138  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.550913  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  41.44 
 
 
354 aa  138  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0109  diguanylate cyclase  37.33 
 
 
461 aa  137  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5712  diguanylate cyclase  42.7 
 
 
316 aa  137  6e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0219  diguanylate cyclase  41.76 
 
 
303 aa  137  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4030  diguanylate cyclase  46.78 
 
 
498 aa  137  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1536  diguanylate cyclase  36.87 
 
 
278 aa  136  1e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370191  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0268  diguanylate cyclase  39.44 
 
 
485 aa  137  1e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.624982  hitchhiker  0.000186113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1507  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.09 
 
 
308 aa  136  1e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.914031 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2332  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.68 
 
 
324 aa  136  1e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.532356  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1387  cyclic nucleotide-binding protein  42.59 
 
 
320 aa  135  2e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243824  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.81 
 
 
367 aa  135  2e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0766  diguanylate cyclase  43.18 
 
 
501 aa  136  2e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1319  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.42 
 
 
610 aa  135  2e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.104887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4930  diguanylate cyclase  36.84 
 
 
530 aa  135  2e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22973 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0504  GGDEF domain-containing protein  43.45 
 
 
385 aa  135  2e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0604  diguanylate cyclase  45.2 
 
 
291 aa  136  2e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.436873  normal  0.310553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0470  GGDEF  43.75 
 
 
412 aa  135  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.606028 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0691  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.51 
 
 
686 aa  135  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343759  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  45.29 
 
 
227 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1148  diguanylate cyclase  33.85 
 
 
634 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0203006  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0719  diguanylate cyclase  42.69 
 
 
370 aa  135  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  37 
 
 
1644 aa  135  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1471  diguanylate cyclase  29.25 
 
 
439 aa  134  4e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  37.8 
 
 
680 aa  134  4e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1922  diguanylate cyclase  47.88 
 
 
527 aa  135  4e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.252712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>