More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8662 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  53.69 
 
 		 212 aa  224  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  45.64 
 
 		 225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 220 aa  144  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 325 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 214 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  35.47 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 218 aa  98.2  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  34.63 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  31.94 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  29.33 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 247 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  36.9 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  41.51 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2939  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 360 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0355871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 226 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 226 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 226 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 232 aa  48.5  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  39.22 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  39.22 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 332 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  38.46 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>