More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3615 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 158 aa  310  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  38.93 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  43.08 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  44.21 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  41 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  37.69 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  42.2 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  37.4 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 167 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  36.69 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  40.59 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  33.98 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  32.52 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  35.71 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.62 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  43.59 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  32.04 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  31.54 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  31.58 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  31.15 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  31.45 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  43.21 
 
 		 193 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  48.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.61 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.61 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  33.91 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  35.58 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 158 aa  47.8  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  37.78 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  29.29 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  29.37 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1485  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 139 aa  47.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.252569  normal  0.356309 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  33.64 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6941  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>