238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3427 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  100 
 
 
341 aa  664    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  53.29 
 
 
326 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
356 aa  279  6e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  48.81 
 
 
324 aa  275  8e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  47.32 
 
 
343 aa  271  9e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  44.31 
 
 
351 aa  249  6e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  43.2 
 
 
314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 
322 aa  241  9e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  45.23 
 
 
336 aa  236  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  43.41 
 
 
308 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  31.52 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 
333 aa  162  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  35.44 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
303 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  36.77 
 
 
305 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
302 aa  149  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  31.85 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.57 
 
 
315 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
314 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  35.27 
 
 
310 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  41.15 
 
 
289 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  39.92 
 
 
311 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  35.99 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  34.35 
 
 
317 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  41.52 
 
 
296 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  34.43 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 
333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
322 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
315 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  36.4 
 
 
301 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  34.87 
 
 
301 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
164 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  28.37 
 
 
208 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 
139 aa  62  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
211 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
194 aa  60.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 
136 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
195 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.41 
 
 
577 aa  57.8  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  28.91 
 
 
142 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 
216 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
140 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 
583 aa  56.6  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
137 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
161 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
129 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 
144 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  50 
 
 
143 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  27.2 
 
 
149 aa  53.9  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 
146 aa  53.1  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
322 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 
149 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
272 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0564  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 
205 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 
154 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 
140 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
237 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 
150 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  54.39 
 
 
229 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
180 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  41.12 
 
 
340 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  25 
 
 
216 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
158 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  47.06 
 
 
140 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  28.57 
 
 
172 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  47.06 
 
 
140 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 
208 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
141 aa  49.7  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  37.27 
 
 
160 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
148 aa  49.3  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  29.82 
 
 
131 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
164 aa  49.3  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
161 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1876  phosphoglycerate mutase family protein  22.99 
 
 
189 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  45.1 
 
 
140 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  45.1 
 
 
140 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  38.53 
 
 
157 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  45.1 
 
 
140 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
160 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  38.53 
 
 
160 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  38.53 
 
 
160 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68309  predicted protein  27.69 
 
 
927 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00286141 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  38.18 
 
 
160 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  38.18 
 
 
160 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
143 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  38.53 
 
 
160 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  30.13 
 
 
153 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 
185 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 
140 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
166 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  33.65 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  40.48 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4015  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.25 
 
 
134 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>