More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1272 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 967 aa  1849    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  54.48 
 
 		 982 aa  847    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  54.18 
 
 		 970 aa  793    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  43.03 
 
 		 983 aa  510  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  39.33 
 
 		 916 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  37.87 
 
 		 993 aa  435  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  35.5 
 
 		 1006 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  37.92 
 
 		 953 aa  336  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  39.15 
 
 		 967 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  37.25 
 
 		 954 aa  227  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 973 aa  224  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 981 aa  222  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  37.69 
 
 		 992 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 		 1005 aa  208  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  34.1 
 
 		 1084 aa  187  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 999 aa  164  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 		 1013 aa  157  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  31.51 
 
 		 959 aa  156  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  35.93 
 
 		 900 aa  152  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  34.77 
 
 		 964 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 		 1022 aa  125  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.35 
 
 		 1089 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  26.87 
 
 		 1020 aa  112  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  32.38 
 
 		 1123 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 		 1402 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.35 
 
 		 1175 aa  107  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 895 aa  105  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  28.95 
 
 		 1138 aa  105  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  30.98 
 
 		 1007 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  31.5 
 
 		 1054 aa  105  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  30.25 
 
 		 1029 aa  104  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  29.82 
 
 		 1067 aa  104  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  32.42 
 
 		 937 aa  103  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.17 
 
 		 1141 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  29.68 
 
 		 1051 aa  102  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  31.3 
 
 		 1029 aa  102  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  28.15 
 
 		 1148 aa  102  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 		 1139 aa  101  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.57 
 
 		 1291 aa  101  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.57 
 
 		 1080 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  28.68 
 
 		 862 aa  99.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.36 
 
 		 1081 aa  97.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 1118 aa  95.5  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  30.7 
 
 		 1071 aa  94.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  28.84 
 
 		 1151 aa  94.7  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.05 
 
 		 1151 aa  93.2  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.43 
 
 		 1403 aa  93.2  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  29.79 
 
 		 713 aa  92  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.39 
 
 		 1422 aa  92.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.69 
 
 		 1117 aa  92  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  31.79 
 
 		 1075 aa  92  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  31.19 
 
 		 1123 aa  91.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  27.98 
 
 		 1090 aa  91.7  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  33.88 
 
 		 937 aa  90.5  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  30.17 
 
 		 914 aa  89.4  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  30.85 
 
 		 1034 aa  89  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  28.8 
 
 		 977 aa  88.6  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  26.93 
 
 		 1141 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  32.42 
 
 		 1109 aa  88.2  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.37 
 
 		 1149 aa  88.2  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  26.93 
 
 		 1141 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  26.93 
 
 		 1141 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  31.12 
 
 		 1121 aa  87.4  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  27.35 
 
 		 1400 aa  87.4  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  30.35 
 
 		 1065 aa  87  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  28.67 
 
 		 872 aa  86.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.91 
 
 		 1134 aa  86.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26.39 
 
 		 1105 aa  85.5  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  32.35 
 
 		 973 aa  85.1  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  28.65 
 
 		 864 aa  85.1  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.28 
 
 		 1805 aa  84.3  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  29.05 
 
 		 1048 aa  84.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  26.93 
 
 		 1142 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  25.98 
 
 		 1037 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.51 
 
 		 1429 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  24.12 
 
 		 1271 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4074  serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 		 1297 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0173368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  28.61 
 
 		 723 aa  82.4  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 1116 aa  81.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.46 
 
 		 1096 aa  81.6  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  60.66 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  28.33 
 
 		 1043 aa  81.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  27.68 
 
 		 1114 aa  81.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  27.56 
 
 		 1126 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  28.6 
 
 		 1377 aa  80.5  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  23.73 
 
 		 1908 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.87 
 
 		 1795 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 1015 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 212 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  34.57 
 
 		 901 aa  79.7  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  31.15 
 
 		 965 aa  79.7  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  29.48 
 
 		 1198 aa  79.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  19.02 
 
 		 1808 aa  79.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  25.47 
 
 		 1094 aa  79  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 881 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  27.2 
 
 		 1836 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  28.33 
 
 		 1685 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  28.41 
 
 		 1685 aa  77.8  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  22.63 
 
 		 1850 aa  77.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  24.71 
 
 		 2361 aa  77  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>