119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1302 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  100 
 
 		 713 aa  1468    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  31.4 
 
 		 334 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  31.69 
 
 		 315 aa  124  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  34.96 
 
 		 310 aa  116  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  30.84 
 
 		 340 aa  107  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  31.2 
 
 		 306 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  23.8 
 
 		 855 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.35 
 
 		 304 aa  97.8  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  25.74 
 
 		 393 aa  94.7  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.98 
 
 		 607 aa  87  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  26.19 
 
 		 384 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  28.68 
 
 		 338 aa  83.2  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.49 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.36 
 
 		 350 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.12 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.21 
 
 		 362 aa  70.5  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  24.55 
 
 		 634 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  24.91 
 
 		 634 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  24.91 
 
 		 634 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  24.06 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.14 
 
 		 628 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.33 
 
 		 314 aa  67  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.97 
 
 		 376 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.16 
 
 		 315 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  25.8 
 
 		 344 aa  67  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  26.2 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 627 aa  64.7  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  26.52 
 
 		 316 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  26.52 
 
 		 316 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  26.52 
 
 		 316 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  26.52 
 
 		 316 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  26.52 
 
 		 316 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  24.3 
 
 		 341 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  25.81 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  26.87 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.92 
 
 		 316 aa  60.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  25.82 
 
 		 324 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  22.38 
 
 		 355 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.08 
 
 		 340 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.14 
 
 		 507 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.17 
 
 		 426 aa  60.1  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.57 
 
 		 517 aa  59.7  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  26.61 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.62 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  28.28 
 
 		 699 aa  57.4  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  22.32 
 
 		 323 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.43 
 
 		 540 aa  55.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  21.82 
 
 		 349 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  23.72 
 
 		 357 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  29.45 
 
 		 550 aa  55.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  27.98 
 
 		 504 aa  55.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.17 
 
 		 315 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  30.56 
 
 		 348 aa  55.1  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.24 
 
 		 524 aa  54.7  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.43 
 
 		 648 aa  53.9  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  24.52 
 
 		 1338 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.61 
 
 		 505 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  28.85 
 
 		 535 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  24.89 
 
 		 319 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  28.04 
 
 		 530 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.64 
 
 		 333 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.64 
 
 		 333 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  23.27 
 
 		 333 aa  52  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.14 
 
 		 378 aa  51.6  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.14 
 
 		 378 aa  51.6  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.79 
 
 		 316 aa  51.2  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.91 
 
 		 315 aa  50.8  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  22.62 
 
 		 472 aa  50.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.97 
 
 		 444 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  21.67 
 
 		 450 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  23.71 
 
 		 377 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 		 508 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  23.65 
 
 		 472 aa  49.7  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  26.21 
 
 		 313 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  30.94 
 
 		 524 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  23.73 
 
 		 345 aa  48.9  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  22.65 
 
 		 580 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  23.24 
 
 		 502 aa  48.9  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  24.28 
 
 		 341 aa  48.9  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.7 
 
 		 346 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  31.88 
 
 		 618 aa  48.5  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  20.4 
 
 		 329 aa  48.5  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  34.29 
 
 		 383 aa  48.5  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  25.76 
 
 		 315 aa  48.5  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1892  hypothetical protein  28.81 
 
 		 214 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.957451 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  22.43 
 
 		 2073 aa  48.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  24.03 
 
 		 518 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 534 aa  47  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.93 
 
 		 392 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 547 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.65 
 
 		 346 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  27.63 
 
 		 315 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  27.63 
 
 		 315 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  29.58 
 
 		 533 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  29.58 
 
 		 829 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  30.43 
 
 		 464 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.53 
 
 		 523 aa  45.8  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>