15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1892 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1892  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.957451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4737  hypothetical protein  87.32 
 
 		 214 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2501  hypothetical protein  44.69 
 
 		 189 aa  137  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3987  hypothetical protein  37.58 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  36.99 
 
 		 1062 aa  95.1  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2522  hypothetical protein  34.15 
 
 		 189 aa  89.7  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1872  hypothetical protein  40.74 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2227  hypothetical protein  37.29 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2675  hypothetical protein  29.85 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.912699  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2526  hypothetical protein  47.46 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.26 
 
 		 1037 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  33.86 
 
 		 1260 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  28.81 
 
 		 713 aa  47.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  32 
 
 		 3197 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2553  Hemolysin-type calcium-binding region  32.08 
 
 		 340 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>