More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1336 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  100 
 
 		 391 aa  780    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  56.52 
 
 		 378 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  33.87 
 
 		 370 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  36.13 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  33.77 
 
 		 374 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  33.77 
 
 		 374 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  34.63 
 
 		 400 aa  199  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  30.98 
 
 		 369 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  30.08 
 
 		 369 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  34.13 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  32.24 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  33.42 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  30.62 
 
 		 369 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  33.68 
 
 		 368 aa  187  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  31.89 
 
 		 435 aa  186  5e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  34.95 
 
 		 386 aa  186  7e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  36.65 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  37.85 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  33.74 
 
 		 325 aa  177  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  37.09 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  30.85 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  30.77 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  35.21 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  35.28 
 
 		 383 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  33.68 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  37.33 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  38.58 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  27.44 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  35.74 
 
 		 379 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  35.74 
 
 		 379 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  29.04 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  34.57 
 
 		 477 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  36.36 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  31.09 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  27.23 
 
 		 393 aa  143  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  26.7 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  27.59 
 
 		 398 aa  139  8.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  29.74 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  32.91 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  30.4 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  27.92 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  32.15 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  25.18 
 
 		 393 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  32.78 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  30.67 
 
 		 376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  31.81 
 
 		 416 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  27.34 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  35.2 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  28.95 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  30 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  35.2 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  26.58 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.27 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.27 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  29.29 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.73 
 
 		 413 aa  123  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  29.58 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  26.43 
 
 		 381 aa  120  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.46 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  37.29 
 
 		 431 aa  116  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.07 
 
 		 381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  30.1 
 
 		 387 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  27.36 
 
 		 376 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  31.8 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  32.36 
 
 		 471 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  32.36 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  30.1 
 
 		 422 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  30.27 
 
 		 402 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  30.66 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  47.46 
 
 		 121 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  26.06 
 
 		 399 aa  106  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  34.32 
 
 		 209 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  29.78 
 
 		 487 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2157  hypothetical protein  46.49 
 
 		 120 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00218836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2095  phage integrase  46.49 
 
 		 120 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2312  hypothetical protein  46.49 
 
 		 120 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.430324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2337  hypothetical protein  46.49 
 
 		 120 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  28.28 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  44.23 
 
 		 429 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  30.29 
 
 		 385 aa  103  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  29.35 
 
 		 494 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  26.73 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  33.77 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  25.31 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  25.31 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  35.42 
 
 		 201 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  26.76 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  28.57 
 
 		 454 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.38 
 
 		 402 aa  96.3  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  24.61 
 
 		 460 aa  96.3  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  25.79 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  29.16 
 
 		 437 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  25.79 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  28.68 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  26.13 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.45 
 
 		 393 aa  94.4  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  26.86 
 
 		 362 aa  94.7  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  33.01 
 
 		 397 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  32.7 
 
 		 407 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>