125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1253 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  100 
 
 		 284 aa  548  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  55.08 
 
 		 285 aa  261  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1650  type II secretion system protein  51.59 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0624732  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  47.54 
 
 		 284 aa  258  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  55.21 
 
 		 286 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2790  type II secretion system protein  54.74 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720201  hitchhiker  0.0010112 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  47.35 
 
 		 285 aa  248  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20410  Flp pilus assembly protein TadB  48.88 
 
 		 290 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  51.29 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1032  type II secretion system protein  53.93 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1236  Type II secretion system F domain protein  49.82 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0780  type II secretion system protein  52.43 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07510  Flp pilus assembly protein TadB  47.01 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1738  type II secretion system protein  60.45 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0857  type II secretion system protein  53.06 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3788  type II secretion system protein  50.85 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  27.88 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  31.1 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  26.02 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  27.71 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  25.97 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  32.3 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  27.75 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  25.56 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  25.64 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  26.55 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  26.55 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  19.47 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  23.89 
 
 		 334 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  26.1 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  25.1 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  23.75 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  25.26 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  26.51 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  26.49 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  27.84 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  26.07 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  23.43 
 
 		 335 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  27.16 
 
 		 327 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  32.12 
 
 		 326 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  26.25 
 
 		 327 aa  52.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 290 aa  52.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  28.34 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  26.18 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  28.33 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  28.34 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  28.34 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  28.35 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  28.07 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  23.84 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  24.06 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  25.91 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  30.16 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  28.92 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  27.49 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  26.17 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  25.4 
 
 		 320 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  37.69 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  22.55 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  25.87 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  28.39 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  26.6 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  25 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  23.95 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20340  Flp pilus assembly protein TadB  27.95 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  0.127493 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  27.21 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  26.83 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  24.29 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2487  type II secretion system protein  22.73 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.744941  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  25.21 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  30.87 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  31.85 
 
 		 325 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7219  type II secretion system protein  25.21 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.981655  normal  0.304711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  25.7 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  27.57 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  28.74 
 
 		 310 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  27.61 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  27.53 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  25.61 
 
 		 287 aa  46.2  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  30.87 
 
 		 325 aa  45.8  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  25.44 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>