71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1032 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1032  type II secretion system protein  100 
 
 		 285 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1236  Type II secretion system F domain protein  66.9 
 
 		 286 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  57.34 
 
 		 284 aa  302  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  56.45 
 
 		 285 aa  289  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1650  type II secretion system protein  58.02 
 
 		 284 aa  288  7e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0624732  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2790  type II secretion system protein  57.54 
 
 		 285 aa  277  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720201  hitchhiker  0.0010112 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20410  Flp pilus assembly protein TadB  53.09 
 
 		 290 aa  275  6e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  59.18 
 
 		 286 aa  265  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  53.93 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  56.44 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  54.71 
 
 		 286 aa  256  4e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07510  Flp pilus assembly protein TadB  53.73 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0780  type II secretion system protein  60.15 
 
 		 296 aa  244  8e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1738  type II secretion system protein  59.02 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0857  type II secretion system protein  52.04 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3788  type II secretion system protein  53.48 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  28.37 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  22.71 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  23.94 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  19.57 
 
 		 535 aa  57  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  24.16 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  25.16 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  24.28 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  25 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  25.41 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  27.08 
 
 		 320 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  29.32 
 
 		 325 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2275  putative integral membrane protein  28.23 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421118  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  26.76 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  30.41 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  23.26 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  25.73 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  32.03 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  29.83 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  29.83 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  25.62 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  28.9 
 
 		 326 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  23.18 
 
 		 327 aa  49.7  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  23.46 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  21.91 
 
 		 328 aa  49.3  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  27.64 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  28.35 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  26.71 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  23.81 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  26.49 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  31.79 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  33.58 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  30.82 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  22.95 
 
 		 316 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  24.44 
 
 		 327 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  34.41 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5620  type II secretion system protein  22.62 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  24.44 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  26.37 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  30.17 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  31.54 
 
 		 348 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  27.65 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  29.66 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  24.84 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 325 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  30.88 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  22.02 
 
 		 283 aa  42.7  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  30.23 
 
 		 316 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  25.76 
 
 		 325 aa  42.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  26.09 
 
 		 310 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  21.33 
 
 		 335 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  26.82 
 
 		 311 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  26.5 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>