132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2672 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  100 
 
 		 284 aa  559  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  77.46 
 
 		 285 aa  433  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07510  Flp pilus assembly protein TadB  59.78 
 
 		 285 aa  296  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20410  Flp pilus assembly protein TadB  55.31 
 
 		 290 aa  280  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1236  Type II secretion system F domain protein  55.94 
 
 		 286 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2790  type II secretion system protein  54.01 
 
 		 285 aa  259  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720201  hitchhiker  0.0010112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1650  type II secretion system protein  50.93 
 
 		 284 aa  258  7e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0624732  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  52.61 
 
 		 285 aa  257  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1032  type II secretion system protein  57.88 
 
 		 285 aa  255  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  53.18 
 
 		 286 aa  244  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  52.75 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  48.31 
 
 		 284 aa  235  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0780  type II secretion system protein  55.47 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1738  type II secretion system protein  54.76 
 
 		 286 aa  222  6e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0857  type II secretion system protein  47.76 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3788  type II secretion system protein  48.71 
 
 		 286 aa  181  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  23.83 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  26.84 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  26.24 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  25.73 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  24.5 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  27.05 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  27.05 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  27.05 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  35.71 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  22.09 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  25.14 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  27.56 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  27.49 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  24.85 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  29.89 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  27.94 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  23.91 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  31.88 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  26.85 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  29.12 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  25 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  25.83 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  27.21 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  24.9 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  34.92 
 
 		 325 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  26.94 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  34.92 
 
 		 325 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  26.06 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 325 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  26.83 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  23.33 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  25.71 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  31.11 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  27.91 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  28.28 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  23.79 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  24.49 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  20.83 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  30.12 
 
 		 325 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  26.51 
 
 		 324 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  25.95 
 
 		 282 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  27.91 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 331 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  24.86 
 
 		 331 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  24.86 
 
 		 331 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  24.86 
 
 		 331 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 331 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 331 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  30.56 
 
 		 325 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  25.4 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  24.07 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  22.9 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  24.79 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  26.87 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  25.18 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  25.56 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  23.98 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2275  putative integral membrane protein  27.36 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421118  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  29.79 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  24.49 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  24.49 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  25.47 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  24.49 
 
 		 325 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  24.59 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  23.95 
 
 		 322 aa  49.7  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  25 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  22.09 
 
 		 283 aa  49.3  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  25.19 
 
 		 335 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  35.71 
 
 		 325 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  29.32 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  25.41 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  23.4 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  28.75 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  26.2 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  24 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0609  type II secretion system protein  23.12 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  25.47 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  28.02 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  34.88 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>