110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5825 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  100 
 
 		 286 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0780  type II secretion system protein  81.34 
 
 		 296 aa  360  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  57.46 
 
 		 285 aa  293  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1650  type II secretion system protein  60.08 
 
 		 284 aa  278  6e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0624732  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  52.94 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1236  Type II secretion system F domain protein  55.24 
 
 		 286 aa  259  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  55.47 
 
 		 286 aa  257  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  50.86 
 
 		 285 aa  255  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2790  type II secretion system protein  50.18 
 
 		 285 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720201  hitchhiker  0.0010112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  55.21 
 
 		 284 aa  252  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20410  Flp pilus assembly protein TadB  52.61 
 
 		 290 aa  246  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1032  type II secretion system protein  69.27 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1738  type II secretion system protein  58.73 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07510  Flp pilus assembly protein TadB  50.38 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0857  type II secretion system protein  47.66 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3788  type II secretion system protein  52.36 
 
 		 286 aa  178  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  27.39 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  28.87 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  25.1 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  27.4 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  30.64 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  26.29 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  29.33 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  25.13 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  22.18 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  21.54 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  26.83 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  26.89 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  22.04 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  28.31 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  25.85 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  32.58 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  28.31 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  24.6 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  25.33 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  24.56 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  23.89 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  21.21 
 
 		 535 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  24.69 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  25.33 
 
 		 327 aa  53.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  25.5 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  23.91 
 
 		 336 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 325 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  31.78 
 
 		 325 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  23.81 
 
 		 320 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  27.05 
 
 		 324 aa  52.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  24.56 
 
 		 322 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  22.54 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  31.55 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  32.56 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  22.27 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  24.6 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  25.82 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  24.21 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  25.26 
 
 		 325 aa  50.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  29.33 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  23.81 
 
 		 320 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 323 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  31.78 
 
 		 325 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 326 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  25.36 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  31.78 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  21.99 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  22.28 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  24.6 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  22.71 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  29.49 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  28.98 
 
 		 325 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  23.31 
 
 		 322 aa  46.2  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  24.18 
 
 		 324 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 293 aa  45.8  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 349 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  31.78 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  27.54 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  25.22 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  24.53 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  27.23 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  30.84 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  22.73 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  26.12 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  22.47 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  25.8 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  25.22 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  25.22 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  23.71 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06192  Flp pilus assembly protein TadB  30.85 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  25.36 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0373  type II secretion system protein F  26.11 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.232118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>