29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4456 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  100 
 
 		 300 aa  577  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  92.98 
 
 		 300 aa  494  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  36.84 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  37.13 
 
 		 289 aa  129  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  36.44 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  45.22 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  36.32 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  35.4 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  35 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  34.26 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  33.79 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  36.12 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  33.22 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  32.06 
 
 		 291 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  30 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  34.5 
 
 		 348 aa  99  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  31.41 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  37.13 
 
 		 302 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  35.32 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  36.26 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  31.82 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1236  Type II secretion system F domain protein  27.98 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  27.91 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  27.7 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  27.1 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2790  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720201  hitchhiker  0.0010112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  30.84 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  25.79 
 
 		 680 aa  42.7  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>