24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0672 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 300 aa  566  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  41.75 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  41.64 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  42.45 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  43.7 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  40.58 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  39.26 
 
 		 291 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  42.06 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  39.04 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  35.86 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  34.31 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  38.31 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  33.11 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  38.52 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  38.65 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  41.96 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  41.13 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  39.48 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  31.16 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  36.44 
 
 		 348 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  30.98 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  27.09 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  27.38 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  26.88 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>