32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0841 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  100 
 
 		 289 aa  546  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  59.51 
 
 		 291 aa  294  9e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  48.98 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  42.2 
 
 		 331 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  37.16 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  47.44 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  39.7 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  37.12 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  40.62 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  37.41 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  35.56 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  38.16 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  41.36 
 
 		 299 aa  105  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  37.24 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  37.99 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  35.51 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  34.24 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  42.22 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  38.22 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  32.85 
 
 		 291 aa  89.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  29.83 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  29.19 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  26.1 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 336 aa  45.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0780  type II secretion system protein  27.65 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2790  type II secretion system protein  26.16 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720201  hitchhiker  0.0010112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  29.81 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  27.78 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  25.82 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0033  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  21.6 
 
 		 247 aa  43.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  25.42 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>