20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3331 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  574  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  54.59 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  32.46 
 
 		 297 aa  85.5  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  30 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  31.91 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  35.87 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  28.14 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  28.16 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  28.8 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  29.35 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  33.14 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  31.52 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  30.23 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  29.55 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  27.19 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  30.81 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  29.78 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>