23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8598 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  100 
 
 		 291 aa  570  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  44.26 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  42.32 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  44.64 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  43.78 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  44.49 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  36.32 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  34.14 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  38.89 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  36.36 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  33.57 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  33.59 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  35.53 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  35.71 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  37.22 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  30.96 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  33.47 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  32.85 
 
 		 289 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  31.56 
 
 		 310 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  32.43 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  31.48 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  30.52 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  25 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>