30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4141 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  100 
 
 		 331 aa  626  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  68.18 
 
 		 295 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  55.97 
 
 		 291 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  56.33 
 
 		 303 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  45.71 
 
 		 302 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  41.04 
 
 		 348 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  47.97 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  43.91 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  40.49 
 
 		 297 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  40.07 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  36.65 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  35.56 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  40.82 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  35.81 
 
 		 290 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  37.77 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  39.35 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  36.84 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  36.32 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  34.09 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  43.24 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  30.23 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  29.5 
 
 		 287 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 660 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1406  type II secretion system protein  27.4 
 
 		 322 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  25.24 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  24.2 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  25.24 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  20.24 
 
 		 323 aa  42.7  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  24.53 
 
 		 323 aa  42.7  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>