28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2761 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  100 
 
 		 302 aa  578  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  49.37 
 
 		 291 aa  209  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  51.05 
 
 		 295 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  51.15 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  51.09 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  46.12 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  38.63 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  37.85 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  36.74 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  44.4 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  33.81 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  32.51 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  40.55 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  38.57 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  34.6 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  38.91 
 
 		 302 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  34.14 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  35.81 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  36.17 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  35.84 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  28.09 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  34.38 
 
 		 660 aa  55.8  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  28.26 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  24.73 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  26.42 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  30.58 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  24.06 
 
 		 323 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>