23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2593 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  100 
 
 		 302 aa  579  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  88.42 
 
 		 302 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  40.35 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  42.66 
 
 		 296 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  39.93 
 
 		 291 aa  168  9e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  37.72 
 
 		 290 aa  165  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  42.37 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  38.41 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  39.62 
 
 		 348 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  40.6 
 
 		 331 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  41.07 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  43.46 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  34.69 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  38.2 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  36.46 
 
 		 289 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  37.13 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  35.22 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  37.82 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  41.78 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  29.41 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  30.67 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>