22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4728 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  100 
 
 		 297 aa  583  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  52.17 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  46.31 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  44.95 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  37.85 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  40.97 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  42.86 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  36.89 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  36.32 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  34.48 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  32.37 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  34.68 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  38.53 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  34.43 
 
 		 300 aa  94.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  34.67 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  35.22 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  33.91 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  33.06 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  31 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  36.69 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  37.3 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  30.7 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>