25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1735 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  100 
 
 		 302 aa  574  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  88.78 
 
 		 302 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  39.58 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  42.55 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  39.63 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  43.01 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  44.64 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  40.96 
 
 		 348 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  37.76 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  40.52 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  41.74 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  41.53 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  33.1 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  37.06 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  36.96 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  32.86 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  34.5 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  36.68 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  39.56 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  28.8 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  29.44 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  25.44 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  25.97 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2790  type II secretion system protein  25.7 
 
 		 285 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720201  hitchhiker  0.0010112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>