35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8204 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  100 
 
 		 303 aa  589  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  57.31 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  57.3 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  58.19 
 
 		 291 aa  258  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  46.21 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  46.83 
 
 		 348 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  46.1 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  41.67 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  38.28 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  38.72 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  43.16 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  36.74 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  41.11 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  37.4 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  37.28 
 
 		 291 aa  126  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  40 
 
 		 300 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  35.92 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  37.89 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  39.32 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 310 aa  86.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  31.52 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 325 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  24.47 
 
 		 335 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  22.14 
 
 		 322 aa  48.9  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  24.59 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  31.61 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  24.59 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  27.65 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  26.01 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  23.33 
 
 		 323 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  25.16 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  24.47 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  29.11 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 660 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>