41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1224 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 297 aa  566  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  42.42 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  41.52 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  42.02 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  36.24 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  40.97 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  41.52 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  41.63 
 
 		 331 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  37.23 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  35.66 
 
 		 348 aa  126  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  34.56 
 
 		 291 aa  123  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  41.67 
 
 		 302 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  36.08 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  37.61 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  38.64 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  36.32 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  37.17 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  33.2 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  38.72 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  36.36 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  33.92 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  34.09 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  30.59 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  27.96 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  27.07 
 
 		 337 aa  49.7  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  24.05 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  24.46 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  24.46 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  32.88 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  25.2 
 
 		 335 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  25.11 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  27.07 
 
 		 310 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  25.17 
 
 		 310 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  25.98 
 
 		 327 aa  45.8  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  25.88 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  22.67 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  28.47 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  27.65 
 
 		 320 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1755  type II secretion system protein  21.97 
 
 		 306 aa  42.4  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0468876  normal  0.156837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>