37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3133 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  100 
 
 		 291 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  56.27 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  61.75 
 
 		 331 aa  247  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  60 
 
 		 303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  49.37 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  48.25 
 
 		 348 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  46.31 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  48.26 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  40 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  36.04 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  37.23 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  40.15 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  37.25 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  40.62 
 
 		 289 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  36.32 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  37.37 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  30.83 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  36.84 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  34.89 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  36.93 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  32.08 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  26.86 
 
 		 325 aa  52.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  25.71 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  29.3 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  29.3 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  29.3 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  29.3 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  29.3 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  29.3 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  25.71 
 
 		 325 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  22.73 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  27.33 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  26.45 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  34.4 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  24.87 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3511  type II secretion system protein  24.57 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798024  normal  0.0839848 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  24.64 
 
 		 279 aa  42.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>